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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2006 目的探讨利用PCR-SSCP分析技术进行粪便脱落细胞中p53基因突变检测用于大肠癌早期筛选诊断的可能性。方法对40例大肠癌患者留取手术切除的癌组织及术前保存的粪便。分别从肿瘤组织及粪便中提取DNA。应用基因扩增-单链多态性分析-溴乙锭（PCR-SSCP-EB）染色方法检测两种标本中p53基因扩增情况及第5、6、7、8外显子突变情况,进行对照分析。结果p53基因特异性扩增产物及58外显子突变在肿瘤组织及粪便脱落细胞中广泛存在。肿瘤组织中p53基因突变27例,粪便中24例,其p53突变检出的敏感性为60 ...
张纯海, 马冲, 盖宝东, 王巍
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野生动物学报, 2022 动物在生长发育不同阶段组织器官的代谢水平有所差异,线粒体DNA(mtDNA)的拷贝数在一定程度上反映了机体的生理状态和代谢强度。以64只大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)粪便DNA为材料,采用实时荧光定量PCR方法,验证了肠道上皮组织中平均每个细胞mtDNA的拷贝数(Nmpc)与月龄之间具有显著相关性(R2=0.129,P=0.004),且呈现出随着月龄的增长而下降的趋势。幼龄个体的Nmpc远高于中、老龄个体,且个体差异很大。此外,性别对Nmpc也具有明显的影响 ...
任晓彤 +7 more
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野生动物学报, 2015 为了研究猞猁肠道菌群结构,筛选出致病菌,南京市红山森林动物园采集了4只猞猁的粪便样本(2只正常,2只生病),事先对粪便进行预处理,用酚-氯仿法提取基因组DNA,以此作为PCR反应模板,扩增16S rRNA基因V3区,并将扩增产物进行DGGE电泳,以筛选粪便样本的差异菌群。通过Quantity one软件对DGGE图谱进行相似度分析,发现非疾病样本之间的相似度为0.92,疾病样本之间的相似度为0.96,非疾病和疾病样本之间的相似度为0.65～0.67 ...
赵玲玲
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野生动物学报, 2018 本试验的目的是采用高通量测序技术,研究北京动物园3只亚成体大熊猫肠道细菌的多样性,比较分析在其刚从成都回北京动物园饲养(14月龄)和饲养2个月后(16月龄)的粪便菌群差异,以及3只个体之间的差异。共采集新鲜粪便样品19份,提取DNA,然后用Illumina MiSeq平台测序分析。结果表明:3只亚成体大熊猫粪便细菌,在门水平上主要是变形菌门(Proteobacteria),平均占55.5%,厚壁菌门(Firmicutes)平均占42.5%; 在属水平上,大肠志贺氏杆菌属(Escherichia ...
刘 燕 王 曦 刘学锋 李林海 郑常明 夏茂华 张成林
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野生动物学报, 2014 为了解野生天山马鹿哈密种群的微卫星多态性,本文选用5 对微卫星标记引物,利用粪便DNA分析法、PCR 和复合电泳银染技术,通过计算基因频率(P)、有效等位基因数(Ne)、群体杂合度(He)、多态信息含量(PIC)和遗传距离,对冬季采集的201 份天山马鹿粪便进行了研究,评价了其遗传多样性和系统进化分析。结果表明:成功提取DNA的194份粪便分属140个体; 种群平均等位基因4.200±0.837; 平均有效等位基因数3.2167±0.0236; 平均多态信息含量0.6332±0.0017 ...
夏米西丁·阿不都热依木 艾斯卡尔·买买提 布左拉·吐尔逊孜拉吉古丽·西克然木 阿依努尔·阿卜杜艾尼 马合木提·哈力克
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利用Illumina MiSeq测序平台分析健康与腹泻食蟹猴粪样菌群
野生动物学报, 2019 本试验通过对比健康与腹泻食蟹猴粪便菌群的差异，初步探讨腹泻对食蟹猴粪便菌群的影响。采集成年腹泻与健康食蟹猴粪样各6份，用细菌16Sr DNA通用引物扩增V3—V4 区，采用Illumina MiSeq测序平台对食蟹猴粪便微生物进行研究。结果表明，Alpha多样性指数分析，健康组与腹泻组的微生物多样性指数（Shannon、Simpson）差异不显著，群落丰富度指数（Chao、Ace）差异显著。PCA主成分分析，健康组与腹泻组粪便菌群具有明显的差异。通过对健康组与腹泻组物种菌群组成分析 ...
张飞燕 1 金洁 1 刘超 1 胡正飞 1 张玉林 1 谢丽分 1 邬继文 1 吕龙宝 1
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应用手足口病病原体验证改良的DNase-SISPA方法检测未知病毒感染的特异性
Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2010 目的以引起手足口病的肠道病毒EV71为研究对象,在DNaseI-非序列依赖的单引物扩增技术的基础上建立感染性疾病RNA病毒性病原体的检测方法。方法根据卫生部发布的《手足口病预防控制指南》（2008年版）附件手足口病实验室检测方案（试行）,收集临床诊断手足口病的患儿粪便,经实验室RT-PCR检测阳性后,进行过滤、DNase消化处理。反转录、合成病毒RNA的双链cDNA,Taq I酶切双链cDNA,加接头分子,并以接头分子为引物非特异扩增病原基因,测序并进行序列分析 ...
于庭 +4 more
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野生动物学报, 2021 动物肠道中寄生着数以亿计的微生物,参与到动物机体中如代谢和免疫等重要的生理过程中。然而,在粪便等复杂样本中包含着大量微生物,无法通过纯培养技术进行研究,无法评估样本中的微生物多样性。通过宏基因组学技术可以对微生物群总DNA进行分析,使其成为目前研究复杂样本微生物结构和功能的重要工具。并且伴随高通量测序技术和生物信息学的进步,对微生物的分析流程也在不断地被改进。本文比较了在宏基因组学中普遍应用的标志基因扩增子分析和全宏基因组分析,对宏基因组技术在几类野生脊椎动物肠道微生物领域中的应用进行综述 ...
赵宇卓 吴 尽 杨天雄 姚茂林 裴 欣 付蓝仪 刘学东
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野生动物学报, 2023 为了解蓝孔雀（Pavo cristatus）肠道菌群中整合子及其基因盒的分布特征，以2个动物园蓝孔雀粪便为材料，采用CTAB法提取肠道菌群宏基因组DNA，共计139份；通过PCR法扩增整合子、基因盒，选取部分PCR产物测序。结果显示：整合子intI1、intI2和intI3检出率分别为86.33%、69.78%和11.51%；不同大小的基因盒条带有 18种，共51种组合模式。研究表明蓝孔雀种群中整合子流行性较高，且Ⅰ类整合子携带的基因盒具有高度异质性，反映了蓝孔雀种群潜在多重耐药的复杂性 ...
陶芬 +7 more
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浙江大学学报. 农业与生命科学版To establish a rapid detection method for Toxoplasma gondii oocysts in cat fecal samples using recom-binase polymerase amplification combined with a lateral flow strip (RPA-LF), we designed RPA primers and probes based on the highly conserved RE-529 ...
DENG Manqin(邓鳗琴) +5 more
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