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现有的粪便DNA提取方法通用性不好,DNA纯度不高不适用于白头鹤等水鸟,本研究探索一种改进的硫氰酸胍裂解法。通过线粒体DNA细胞色素b、控制区基因和微卫星DNA的PCR扩增及线粒体DNA控制区序列的测定,经琼脂糖凝胶电泳检测以及测定序列显示,提取的DNA模板纯度高,效果很好,证实改进方法的可靠性、有效性。为其他濒危水鸟的非损伤取样提供了新的材料和方法,为其保护遗传学的研究提供一定的新技术。
代艳丽, 周立志
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动物在生长发育不同阶段组织器官的代谢水平有所差异,线粒体DNA(mtDNA)的拷贝数在一定程度上反映了机体的生理状态和代谢强度。以64只大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)粪便DNA为材料,采用实时荧光定量PCR方法,验证了肠道上皮组织中平均每个细胞mtDNA的拷贝数(Nmpc)与月龄之间具有显著相关性(R2=0.129,P=0.004),且呈现出随着月龄的增长而下降的趋势。幼龄个体的Nmpc远高于中、老龄个体,且个体差异很大。此外,性别对Nmpc也具有明显的影响 ...
任晓彤 +7 more
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目前,栖息地的破坏是野生动物处于濒危状态的主要因素之一。东北马鹿是国家重点保护动物,近年来,人类活动的干扰使其生境明显减少并呈斑块状分布,这将使东北马鹿的种群遗传结构发生变化。然而,在野生动物遗传结构研究中,传统的取样方法直接或间接地对动物造成了伤害。因此,本文以粪便为研究材料,对来自完达山地区的9个东北马鹿样品进行mtDNA序列分析,共发现29个变异位点,定义了7个单倍型,其单倍型多样性(h)平均值为0.917、核苷酸多样性(π)平均值为2.803,种群总体遗传多样性较高 ...
刘艳华, 张明海
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为了解大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)肠道脱落细胞中线粒体DNA(mtDNA)的异质性特点及其与年龄的关系,以92只不同年龄的大熊猫粪便为材料,通过扩增子高通量测序研究非编码的D-loop区、编码rRNA的16S rRNA区以及编码蛋白质的ND1和ND2区的异质性。结果显示:D-loop区存在3个异质性热点区段,突变碱基的数量远远高于其他3个编码区;D-loop区TS/TV小于16S rRNA和ND两个编码区,表明后两者较D-loop区受到更强烈的纯化选择 ...
李晓达 +8 more
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粪便皮质醇激素对衡量动物应激强度具有较好的指示作用,但其检测准确性受诸多因素影响。为了评估不同取样方式对大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)粪便皮质醇测定产生的影响,将粪便横向纵向四等分分割,采用冻干研筛法与酶联免疫吸附法(ELISA)处理每部分粪便和测定激素含量,旨在分析粪便激素分布情况以进一步探讨取样对策。结果显示:每部分粪便的皮质醇含量无显著差异(df=3,F=0.033,P=0.992),粪便在四等分处理下的激素分布比较均匀,即每部分粪便激素均能在一定程度上代表整体水平。1 ...
罗 波 +12 more
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为提高圈养南白犀(Ceratotherium simum simum)的繁殖成功率,开展了粪便睾酮水平与其年龄关系研究,采集46头不同年龄雄性南白犀的粪便,测定粪便睾酮含量,记录繁殖成功率。结果表明:圈养雄性南白犀的粪便睾酮水平与其年龄有一定的相关性,呈现随年龄增加逐步增多的趋势,10岁后,粪便睾酮水平显著上升 ...
王 宇 +7 more
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利用不同孔径筛网对真空冷冻干燥后的大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)粪便进行筛取以量化粪便颗粒大小,采用酶联免疫吸附法(ELISA)测定粪便类固醇激素,探究粪便颗粒大小与激素含量的相关性。结果显示:筛网孔径在3个指标下(雌酮-3-葡糖苷酸、孕酮和皮质醇)均存在主效应,且激素含量大致呈现出随筛网孔径增加而减小的特点。3.35 mm(6目)与1.70 mm(10目)孔径筛网筛选的筛下物激素含量整体表现出最低水平,0.88 mm(18目)的激素含量居中,0.43 mm(35目)、0.23 ...
唐丹 +12 more
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为了解不同陆龟的肠道微生物菌群的区系特点,采用高通量测序技术,分析比较人工养殖的缅甸陆龟(Indotestudo elongata)、苏卡达陆龟(Centrochelys sulcata)、辐射陆龟(Astrochelys radiata)和豹龟(Stigmochelys pardalis)粪便微生物多样性。结果表明:厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、互养菌门(Synergistetes)和变形菌门(Proteobacteria)均为4种陆龟的优势菌门 ...
肖嘉杰 +7 more
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野生动物应激水平的非损伤性评估是了解野生动物对景观条件产生生理反应的重要方法。粪便皮质醇代谢产物(faecal cortisol metabolites,FCM)水平被认为是评价动物压力的潜在生物标志物。影响濒危东北马鹿(Cervus elaphus xanthopygus)应激的环境因子可能包括道路、植被、人为干扰和海拔等,因此采用酶联免疫分析法(ELISA)分析内蒙古高格斯台罕乌拉国家级自然保护区东北马鹿种群的粪便皮质醇激素数据,利用多元线性回归模型构建东北马鹿粪便皮质醇激素与环境因子的线性关系 ...
李剑峰, 孙悦, 张明海
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目的探讨利用PCR-SSCP分析技术进行粪便脱落细胞中p53基因突变检测用于大肠癌早期筛选诊断的可能性。方法对40例大肠癌患者留取手术切除的癌组织及术前保存的粪便。分别从肿瘤组织及粪便中提取DNA。应用基因扩增-单链多态性分析-溴乙锭(PCR-SSCP-EB)染色方法检测两种标本中p53基因扩增情况及第5、6、7、8外显子突变情况,进行对照分析。结果p53基因特异性扩增产物及58外显子突变在肿瘤组织及粪便脱落细胞中广泛存在。肿瘤组织中p53基因突变27例,粪便中24例,其p53突变检出的敏感性为60 ...
张纯海, 马冲, 盖宝东, 王巍
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