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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2006 目的筛选与精子发生相关的基因。方法将不同发育阶段的小鼠睾丸组织cDNA探针与Affymetrix全基因组芯片进行杂交,通过杂交信号的比较,筛选出差异表达的基因。利用网络信息资源对该基因进行生物学信息分析。RT-PCR分析该基因在小鼠不同发育阶段睾丸及小鼠不同组织中的表达。结果通过4、91、8、35、54、日龄和6月龄小鼠睾丸的芯片信号比较筛选出一个差异表达杂交点（GenBank登录号:NM-026234）,生物信息学分析发现该基因全长3 979 bp,含有1 272 bp的完整ORF ...
唐爱发 +7 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2023 目的 基于微阵列数据分析筛选中国人冠心病(CHD)的关键基因和信号通路，以期为临床探究潜在的发病机制与治疗靶点。方法 以CHD为检索关键词从基因表达图谱(GEO)数据库下载GSE71226微阵列芯片数据进行进一步分析，利用R Studio软件中“limma”包筛选冠心病患者与正常健康人群的差异基因并对其进行可视化处理，利用R Studio软件中“clusterProfiler”包和“org.Hs.eg.db”包对差异基因进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析 ...
王星 +5 more
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谷胱甘肽还原酶影响结肠癌代谢及预后：一项基于蛋白组学与微阵列芯片分析的研究
Zhongguo shiyan zhenduanxue目的 探讨谷胱甘肽还原酶(Glutathione reductase, GSR)对结肠恶性肿瘤代谢的影响及其对结肠癌患者的预后价值。方法 通过蛋白组学差异分析获得结肠癌组织和正常结肠上皮组织的差异蛋白，并通过富集分析和蛋白-蛋白相互作用网络(PPI)分析鉴定代谢通路中的关键蛋白，进行生存分析和临床信息相关性分析。收集120例结肠癌患者手术病理标本制作组织微阵列芯片，进行免疫组织化学染色。结果 蛋白组学差异分析共鉴定出1 209个差异表达蛋白。KEGG富集分析显示，差异蛋白显著富集于代谢通路 ...
吴惧 +4 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2017 随着高通量测序、基因芯片等技术的兴起以及生物信息学的应用,大量的基因组转录本被揭示,从此众多的研究成果不断涌现,为揭示基因中的奥秘提供了新思路。研究发现[1],人类93%的基因组DNA可转录成RNA,编码蛋白的基因仅仅为人类基因组的2%[2],而其余98%则为不具有或具有极低蛋白质编码功能的非编码RNA（non-coding RNA,ncRNA）。成百上千个非编码RNAs被转录,并且被认为是具有不同大小、结构和生物功能的功能性RNA ...
孙延文, 印璞, 于庭
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2022 目的 探讨膀胱癌发病的关键基因以及发病机制通路。方法 通过GEO数据库搜索膀胱癌基因芯片测序结果，计算机R语言（limma数据包）对测序原始数据进行均一化处理，GEO2R检测差异基因，通过芯片融合分析锁定共同发病基因。使用最新版本生物信息学分析对膀胱癌测序结果进行数据挖掘，包括DAVID基因转换、基因本体分析、KEGG信号通路分析，STRING蛋白互作分析，Cytoscape可视化处理，cytohubba筛选膀胱癌关键基因。结果GSE61615包含2例膀胱癌组织和2例癌旁正常组织 ...
邢晨 +4 more
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siRNAs干扰EBNA1下调EBV阳性鼻咽癌细胞内ALOX12的表达
Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2010 【目的】 利用RNA干扰技术抑制C666-1细胞中EB病毒核抗原1(EBNA1)的表达,探索氧化应激与抗氧化相关基因的表达变化65377; 【方法】 采用蛋白质印迹证实了能有效抑制EBNA1表达的干扰序列,使用甲基噻唑基四唑(MTT)方法检测C666-1细胞的存活率,利用实时定量PCR芯片技术探索了氧化应激与抗氧化相关基因的转录谱变化,并通过反转录聚合酶链反应(RT-PCR)和蛋白质印迹进行了验证65377;【结果】 EBNA1-1414和EBNA1-1437干扰序列转染C666-1细胞48 h后 ...
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谷胱甘肽还原酶影响结肠癌代谢及预后：一项基于蛋白组学与微阵列芯片分析的研究 附视频
Zhongguo shiyan zhenduanxue目的 探讨谷胱甘肽还原酶(Glutathione reductase, GSR)对结肠恶性肿瘤代谢的影响及其对结肠癌患者的预后价值。方法 通过蛋白组学差异分析获得结肠癌组织和正常结肠上皮组织的差异蛋白，并通过富集分析和蛋白-蛋白相互作用网络(PPI)分析鉴定代谢通路中的关键蛋白，进行生存分析和临床信息相关性分析。收集120例结肠癌患者手术病理标本制作组织微阵列芯片，进行免疫组织化学染色。结果 蛋白组学差异分析共鉴定出1 209个差异表达蛋白。KEGG富集分析显示，差异蛋白显著富集于代谢通路 ...
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2011 目的评价多肿瘤标志物联合检测在消化系统疾病的应用。方法使用HD-2OO1A多肿瘤标志物蛋白芯片检测系统（C12）联合检测2007年2月至2010年2月消化科住院患者393例血清肿瘤标志物。结果恶性肿瘤组和良性疾病组C12单个肿瘤标志物阳性率分别为67.44%和30.68%,肿瘤组显著高于良性疾病组 ...
张亚南 +5 more
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应用CSC-GE-80基因芯片筛查人子宫内膜早期异位种植的血管生长相关基因
Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2007 【目的】探讨子宫内膜异位早期种植的相关基因,特别是与早期种植相关的血管生长基因。【方法】采用裸鼠人子宫内膜皮下种植的方法,建立裸鼠人子宫内膜异位症模型,在种植后14d,取出成模病灶与未种植内膜进行CSC-GE-80基因芯片筛查比较。【结果】在基因表达谱中最有显著性上调基因50个,最有显著性下调基因47个,包括生长因子和细胞因子及其受体的变化,其中生长因子受体结合蛋白10（growth factor receptor-bound protein10,Grb10）与丁酸盐反应因子1（butyrate ...
王宁宁 +9 more
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人骨髓间充质干细胞成骨分化早期相关的长链非编码RNA的初步研究
Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2016 摘 要:【目的】 筛选与人骨髓间充质干细胞(hMSC)成骨分化早期相关的长链非编码RNA(lncRNA),分析其对于hMSC成骨分化早期的影响?【方法】 将成骨诱导分化7 d前后的hMSC作为研究对象,利用Agilent lncRNA芯片技术筛选出成骨诱导分化前后表达量具有2倍差异的lncRNA,选取其中1条表达量差异较大的lncRNA利用UCSC Genome Browser分析此lncRNA邻近蛋白编码基因?【结果】 hMSC经过成骨分化诱导7 d后具有明显成骨细胞特征;Agilent ...
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