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基于生物芯片检测结直肠癌相关基因的甲基化

open access: yesZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2014
摘 要:【目的】 应用微矩阵基因芯片技术筛选结直肠癌甲基化基因?【方法】 分别提取6对结直肠癌组织和癌旁正常组织DNA,超声破碎及甲基化DNA富集后与甲基化芯片(NimbleGen human DNA Methylation 3 × 720K CpG)进行杂交,杂交信号经扫描等处理后采用生物信息学对检测结果进行分析?并对筛选出来的基因进行验证?【结果】 一共发现有2 296个高甲基化基因,其中有293个基因无文献报道?生物信息学分析显示,所有的甲基化基因随机分布在24对染色体上?聚类分析结果显示 ...
doaj  

Study of the negative feedback loop of OVOL2 on WNT signaling in colorectal cancer progression [PDF]

open access: yes, 2015
背景与目的:激活的Wnt信号通路能够促进多种癌细胞的侵袭,而在结直肠癌(CRC)的进展中WNT信号通路参与与否及其参与的机制均知之甚少。OVOL2是Ovo家族成员之一,是由WNT信号通路调控的,具有保守锌指结构的转录因子。该课题主要研究了OVOL2在小鼠和人类肠道肿瘤中的表达和功能,及其协同WNT信号通路在肠道肿瘤进展中的作用。 方法:利用免疫印迹法和实时荧光定量PCR,检测七种结直肠癌细胞中OVOL2蛋白的表达及其mRNA的水平;利用免疫组织化学(IHC)方法,检测OVOL2在结直肠癌组织芯片中的表达;
叶国栋
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Research Progress on Age Estimation Based on DNA Methylation#br# [PDF]

open access: yes, 2019
Age estimation is of great significance in the fields of criminal investigation and forensic identification. It can provide the age information of individuals to judicial departments to facilitate the development of judicial work.
MENG Hang, MA Kai-jun, DONG Li-min,et al.
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鼻咽癌颈淋巴结转移相关甲基化基因的筛选

open access: yesZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2016
摘 要: 【目的】 分析鼻咽癌全基因组基因甲基化状态,筛选鼻咽癌颈淋巴结转移相关的甲基化基因?【方法】 收集I期(T1N0M0)鼻咽癌石蜡标本及有颈部淋巴结转移的鼻咽癌组织标本(T1-4N1-3M0)各4例,分别提取DNA,富集两组样品基因组甲基化片段后采用甲基化芯片对两组标本进行高通量测序分析,对杂交信号进行扫描及初步数据处理,分析并筛选出两组标本的差异甲基化基因?
doaj  

Study on the mechanisms of Pygopus-2 promoting invasion and metastasis in hepatocellular carcinoma [PDF]

open access: yes, 2016
第一部分Pygopus-2在HCC中高表达与病人恶性预后密切相关 Pygopus-2是经典Wnt/β-Catenin信号通路转录复合体的重要成分。本研究目的是观察在原发性肝癌中Pygopus-2的表达情况及相关的临床病理意义。RT-PCR的方法检测50对肝癌病人组织标本中癌组织与癌旁组织中Pygopus-2的mRNA表达情况,结果发现癌组织中Pygopus-2的mRNA水平明显高于癌旁组织(P=0.009)。免疫组化分析显示异常表达的Pygopus-2蛋白与肝癌病人的年龄(P=0.025)、肿瘤大小(P=
李杰
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Establishment of DNA methylation-related gene mutation detection method and analysis of clinical significance on acute myeloid leukemia [PDF]

open access: yes, 2013
目的:建立基于探针熔解曲线法的检测DNA甲基化相关基因突变的PCR体系,了解DNA甲基化相关基因突变在急性髓系白血病(Acutemyeloidleukemia,AML)患者中的发生率和类型,分析伴有DNA甲基化相关基因突变的患者的临床特征和突变在AML中的预后价值。 方法:利用重叠延伸法构建相应质粒,设计探针、引物,优化检测体系的相关参数,建立一种可快速检测DNA甲基化相关基因突变的方法。 收集133例急性髓系白血病患者的骨髓标本,提取细胞RNA,逆转录成cDNA,采用所构建的检测体系 ...
王航
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Genome-wide DNA Methylation status in Neonates affected by Maternal Organochlorine Pesticides Exposure during Pregnancy [PDF]

open access: yes, 2017
研究背景 双对氯苯基三氯乙烷(2,2-bis(chlorophenyl)-1,1,1-trichloroethane,DDTs)是在生产生活中最常见的有机氯农药之一(Organochlorinepesticides,OCPs),其半衰期较长,是一类可以通过食物链传递从而蓄积在脂肪组织、而且具有生物放大效应的有机化合物。而产前母亲与胎儿时刻承受着环境污染物暴露的风险。有的感染,特别是早期感染,可能直接导致怀孕失败与流产,或者造成胎儿畸形。关键问题是,对于大部分没有导致流产与畸形的感染 ...
陈江慧
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复发性流产中精子DFI与精索静脉曲张的相关性研究

open access: yesZhongguo shiyan zhenduanxue, 2021
随着对复发性流产的进一步认识,男性精子质量的重视度也逐渐增加,传统精液常规检测有一定的评估价值,但已不能完全评价男性精子质量[1]。现新兴的精子质量评估包括:蛋白质组学[2]、DNA甲基化[3]、凋亡标志物体[4]等。但因其检测技术复杂且昂贵,并未纳入临床检查,现精子DNA碎片化指数(DFI)检测技术越来越受重视,已成为精子质量评估的新标准[5]。另,精索静脉曲张在复发流产影响因素中的研究也越来越重要[6]。
李光, 吴艳楠, 张译夫, 文陶非
doaj  

IDH1 R132 mutations Inhibit Necroptosis by Stimulating DNMT1-Dependent Hypermethylation of the RIP3 Promoter [PDF]

open access: yes, 2017
异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)第132位精氨酸的突变高发于神经胶质瘤和急性髓性白血病等多种癌症中。IDH1突变后不仅丧失了原有的催化功能,更重要的是获得了新的能力,即催化NADPH依赖性的还原反应,把α-酮戊二酸(α-KG)还原成2-羟基戊二酸(2-HG)。研究发现,由于2-HG与α-KG在结构上非常相似,2-HG会抑制α-KG依赖型的双加氧酶TET2的活性,进而导致IDH1突变细胞中DNA甲基化水平的上升。 在本项目中,我们发现了一种新的2-HG调控细胞内DNA甲基化水平的方式 ...
江彬
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早期鼻咽癌基因甲基化谱的初步构建

open access: yesZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2014
摘 要: 【目的】 分析早期鼻咽癌的基因甲基化状态,初步构建早期鼻咽癌的基因甲基化谱?【方法】 收集I期(T1N0M0)鼻咽癌石蜡标本及炎性增生性鼻咽组织各4例,分别提取DNA,富集两组样品基因组甲基化片段后采用甲基化芯片(NimbleGen)对两组标本进行高通量测序分析,对杂交信号进行扫描及初步数据处理,分析并筛选出两组标本的差异甲基化基因?【结果】 4例鼻咽癌石蜡标本中均出现甲基化的基因数目为1 134个,而4例炎性增生性鼻咽组织中均出现甲基化的基因有2 091个 ...
doaj  

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