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荧光实时定量PCR检测线粒体DNA氧化损伤方法初探

open access: yesZhongguo shiyan zhenduanxue, 2010
目的体外构建DNA氧化损伤模型,荧光实时定量PCR检测线粒体DNA氧化损伤。方法体外应用亚甲蓝联合可见光(MBL)方法建立DNA氧化损伤模型,通过8-羟基鸟嘌呤DNA糖苷酶(OGG1)特异性切割氧化损伤位点8-羟基鸟嘌呤(8-oxoG),运用荧光实时定量PCR法检测不同比例混匀的OGG1酶切与未酶切的DNA氧化损伤模板。结果成功构建体外氧化损伤DNA模型,OGG1酶能特异切割氧化损伤位点;OGG1酶切DNA在定量PCR体系模板中所占比例,与线粒体DNA编码基因COⅡ扩增Ct值呈正相关 ...
孙玉   +6 more
doaj  

NIP7促进泛素缀合酶E2 C表达介导甲状腺未分化癌细胞增殖及肿瘤生长

open access: yes浙江大学学报. 医学版
目的:探讨核仁前rRNA加工蛋白NIP7(NIP7)在维持甲状腺未分化癌(ATC)恶性表型中的作用及分子机制。方法:利用基因表达谱芯片(GSE33630)、蛋白质组学数据集(IPX0008941000)和Dependency Map数据库分别分析NIP7在ATC组织中的表达及细胞上的基因敲除效应。通过蛋白质印迹法检测NIP7在正常甲状腺细胞、甲状腺乳头状癌细胞和ATC细胞上的表达及定位。在ATC细胞上转染小干扰RNA并用定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)和蛋白质印迹法检测NIP7的沉默效率 ...
龚 荧荧   +4 more
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[Detection of DNA methylation of HYAL2 gene for differentiating malignant from benign thyroid tumors]. [PDF]

open access: yesNan Fang Yi Ke Da Xue Xue Bao, 2022
Yin Y   +7 more
europepmc   +1 more source

表观遗传学在糖尿病及其慢性并发症中的应用

open access: yesZhongguo shiyan zhenduanxue, 2017
表观遗传学是研究在基因的核苷酸序列不发生改变的情况下,基因发生了可遗传的表达的一门新兴学科。其机制主要包括DNA甲基化,组蛋白修饰,代谢记忆,RNA介导的基因沉默,染色质重塑及基因组印记等。糖尿病是以高血糖及胰岛素缺乏为特征的一种多因素的慢性代谢性疾病,与基因及环境因素相关[1]。近几年,越来越多的研究表明 ...
燕艳, 刘仲祥, 张秀娟
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基于表观基因组学数据分析阿尔茨海默病中差异基因表达的研究

open access: yesZhongguo shiyan zhenduanxue
目的 利用表观基因组学数据探究阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease, AD)中差异基因的表达。方法 从GEO(gene expression omnibus, GEO)数据库中下载mRNA表达微阵列数据集GSE1297和GSE4757,以及DNA甲基化450 K芯片数据集GSE125895,利用Bioconductor包进行数据预处理,使用R中的limma包筛选出差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)和差异甲基化基因 ...
于倩   +6 more
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研磨-CTAB法与碱性异硫氰酸胍沸腾法提取真菌DNA的比较分析

open access: yesZhongguo shiyan zhenduanxue, 2005
目的对两种病原真菌基因组DNA提取方法[研磨-CTAB(十六烷基三甲基溴化胺)法及碱性异硫氰酸胍沸腾法]的提取效果进行比较,为临床真菌标本的前期处理提供有效参考。方法对来自于同一批培养基的4株申克孢子丝菌及6株普通真菌菌株分别采用研磨-CTAB法及碱性异硫氰酸胍沸腾法抽提基因组DNA,并用紫外分光光度计测定基因组DNA样品OD260和OD280值,计算提取样品的浓度并估计核酸的纯度,然后采用配对资料t检验的统计学方法进行比较。结果碱性异硫氰酸胍沸腾法提取的DNA浓度及纯度均高于研磨-CTAB法 ...
李晓红   +4 more
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限量饮食对致癌物活化代谢及 DNA 断裂的影响

open access: yesZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 1998
目的: 研究限量饮食(DR)对小鼠肝代谢活化致癌物以及致癌物导致的 DNA 链断裂程度的影响。方法: 用32P后标记和高效液相色谱法测定致癌物-DNA 主要加合物生成量; 用随机寡核甘酸引物合成法(ROPS)测定 DNA 链断裂程度; 用体外代谢酶活性测定法检测有关代谢酶的活性。结果:①限量饮食减少小鼠肝中黄曲霉毒素 B1(AFB1) -和 2-乙基氨基芴 ( 2-AAF) -DNA 加合物(AF-C 8-dG)的生成,同时也减少致癌物导致的 DNA 链断裂; 限量饮食增加苯并[ a] 芘( BaP) -
陈 雯 张 桥 吴中亮 周明武
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人原发性肝癌中p16,p15基因CpG岛甲基化研究

open access: yes四川大学学报. 自然科学版, 2002
目的 检测人原发性肝癌中 p16和 p15基因 5’启动子区CpG岛的异常甲基化 ,并分析其与人原发性肝癌发生发展的关系 ,探索其在临床早期基因诊断和治疗中的意义 .方法 用敏感的甲基化特异性PCR检测 2 0例人原发性肝癌患者癌组织、癌旁组织和远癌正常组织中p16 ,p15基因5’CpG岛的甲基化状况 ,统计分析这两个基因 5’CpG岛甲基化与肝癌病理特征的相关性 .结果 2 0例原发性肝癌肝癌组织中 p16和 p15基因 5’CpG岛分别有 6 5 %(13/2 0 )和 5 0 %(10 /2 0
刘建余, 覃扬, 孙芝琳, 孙泽芳
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DNA甲基化与IgA肾病的研究进展

open access: yesZhongguo shiyan zhenduanxue, 2016
众所周知,IgA肾病又称为Berger病,是我国肾小球源性血尿最常见的病因,也是亚太地区最常见的原发性肾小球性肾炎,它以反复发作性肉眼血尿或镜下血尿为特点,有时可有蛋白尿的出现,病理上以肾小球系膜区IgA免疫球蛋白沉积为特征。近几年,IgA肾病的发病率逐年升高,也逐渐趋年轻化。治病重在治本,目前IgA肾病的发病机理并未完全阐明,免疫调节异常成为目前研究的热点和重点。但随着表观遗传学的提出 ...
王欣, 管文瑜, 谭虹, 杜玉君
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亚甲基四氢叶酸还原酶基因多态性和结直肠癌对FOLFOX6方案化疗反应的相关性

open access: yesZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2016
【目的】 分析结直肠癌患者亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因C677T多态性与FOLFOX6方案化疗疗效和毒性的相关性。【方法】 收集经病理学确诊的III-IV期结直肠腺癌患者92例。所有患者均接受FOLFOX6方案化疗,化疗前抽取患者外周血,提取DNA,采用DNA测序的方法检测MTHFR基因C677T多态性,并分析其与化疗方案疗效及毒性的相关性。【结果】 92例结直肠癌患者中,MTHFR C677T CC、CT、TT基因型频率分别为:55.4%、40.2%、4.3 ...
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