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New Sparse Methods for Metabonomic Data Analysis [PDF]
代谢组学是一门以代谢物组分析为基础、以高通量检测为手段、以信息建模与系统整合为目标的新的交叉学科,已成为生命科学研究的热点之一。由于代谢组学数据维数高,且涉及多种技术平台,给代谢组学数据分析提出了巨大的挑战。数据稀疏化是解决高维数据分析的一个有效方法,本文就代谢组学数据稀疏化问题进行深入研究,主要内容如下: 一、提出了基于SIS(SureIndependenceScreening)的稀疏偏最小二乘法,即SIS-SPLS。该方法通过对偏最小二乘法迭代过程中方向向量的求解过程中加入SIS过程,实现了稀疏回归。
徐向南
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The research progress of metabonomics in acupuncture field [PDF]
本文综合分析了国内外关于代谢组学技术运用于针灸机理研究的相关文献,发现目前代谢组学方法已经广泛应用于针灸研究,但是代谢组学研究结果难以全面阐释针灸作用机理,研究结果分析局限于代谢模式改变的分析,缺乏大样本临床试验数据支撑,对针刺、艾灸治疗手段的始动机制研究甚少。This paper aimed to analyze the relevant literature on mechanism studies of metabonomics in acupuncture field.
Chang, Xiao-rong +3 more
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Study of NMR Analysis Technology of Body Fluid in Metabonomics [PDF]
中文摘要 自从1999年Nicholson及其同事在核磁共振(NMR)研究的基础上提出代谢组学(Metabonomics)概念以来,基于NMR代谢组学得到了迅速地发展。基于NMR的代谢组学的直接研究对象是样品的NMR谱,因此基于NMR的代谢组学与NMR分析技术息息相关。有效的水峰抑制、良好的谱图相位和平整的基线对代谢组学的后续统计处理至关重要。 本文对代谢组学中使用的NMR分析技术进行了总结概括,并且以糖尿病患者和正常人的体液样品为对象,进行了不同序列、不同核匀场的NMR实验 ...
肖娴
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Stable Isotope N-Phosphoryl Amino Acids Labeling (SIPAL) for Quantitative Metabolomics Using Liquid Chromatography-Mass Spectrometry [PDF]
代谢组学作为系统生物学的重要组成部分对于生命科学基本机制的揭示及重大疾病标志物的发现具有重要的意义。近年来,随着高效分离技术及高分辨、高灵敏度生物质谱技术的发展,代谢组学分析方法和策略有了较大的提高,特别是在稳定同位素化学标记定量方面。然而,由于代谢物的复杂多样性,微量代谢物的化学结构鉴定和定量分析仍然是当今代谢组学研究面临的巨大挑战。发展具有多功能、高效、高灵敏度等特点的代谢组学定性定量试剂与方法具有重要的科学意义和应用价值。 本文基于“核酸与蛋白共起源”小分子化学进化模型--N ...
张姗姗
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目的对代谢综合征患者血小板参数及血液流变学指标进行观察分析。方法选择单纯性代谢综合征患者20例,合并并发症代谢综合征患者22例,对照者20例作为研究对象。测定3组人员的血细胞比容、红细胞数量、血红蛋白浓度、血小板参数、纤维蛋白原浓度、全血及血浆粘度。结果①代谢综合征患者血小板平均容积、血小板容积分布宽度和大血小板比率高于对照组 ...
徐升强, 王顺
doaj
对NMR波谱数据的统计分析是基于NMR代谢组学研究的关键问题之一.鉴于NMR波谱信号可以近似为样品中各种成分谱信号的线性叠加,本文将非负矩阵分解(NMF)方法引入基于NMR代谢组学的数据处理中,并与代谢组学中常用的统计方法——主成分分析(PCA)进行比较.通过NMF和PCA两种方法对健康志愿者与2型糖尿患者血液和尿液的NMR谱图的统计分析,对所获取的特征代谢物进行比较和验证,并探讨了PCA方法可能存在的不足之处及其原因;阐明了NMF方法是基于NMR的代谢组学研究中较理想的数据分析方法.最后 ...
徐乐 +6 more
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Research Progress in the Application of Proteomics andMetabolomics in Bee Products [PDF]
Bee products are gaining increasing popularity among consumers for their high nutritional value and various biological activities. However, adulteration is becoming a prominent problem in the production and sale of bee products, and the mechanisms ...
Congcong LIN, Qun LU, Rui LIU, Yan ZHAO
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Studies on Biology of Early Developmental Stages of Babylonia [PDF]
东风螺(Babylonia)隶属软体动物门(Mollusca)、腹足纲(Gastropoda)、新腹足目(Neogastropoda)、东风螺科(Babyloniidae),分布于中国东海、南海以及东南亚、日本和印度洋沿岸,因肉质鲜美、市场接受度高,而且生长速度快、养殖产量大,被认为是本世纪最具开发前景的优质海产腹足类之一。方斑东风螺和泥东风螺是我国常见的东风螺种类,对于其早期发育阶段的形态学以及多种组学进行研究,不仅在理论研究上具有科学意义,而且在生产实践上也具有重要的指导意义 ...
沈铭辉
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妊高症患者联合检测血清ACA、抗β2GPⅠ及脂代谢水平的临床意义
目的通过联合检测血清抗心磷脂抗体(ACA)、抗β2糖蛋白Ⅰ抗体(抗β2GPⅠ)及脂代谢(TC、TG、LDL、HDL、ApoA1和ApoB)的水平,探讨其表达水平对不同发病程度妊高症结局的影响。方法将我院产科收治并诊断为妊娠期高血压的孕妇200例作为实验组,依据发病程度又分为轻度子痫前期组70例、重度子痫前期组70例和子痫组60例;同期住院分娩的正常孕妇80例作为对照组。采用Epoch酶标仪和HITACHI全自动生化分析仪检测以上4组受试对象的血清学及脂代谢指标,评估4组受试者血清ACA ...
李介岩, 李晓丽
doaj
NMR-based Metabonomics’ Data Preprocess Methods and Its Application on Diabetes Mellitus Study [PDF]
自从1999年Nicholson及其同事在核磁共振(NMR)研究的基础上提出代谢组学(Metabonomics)以来,基于NMR的代谢组学得到了迅速地发展。由于机体病理的变化,代谢产物产生了某些相应的变化,利用NMR手段就可以检测到这些代谢产物的变化。对NMR数据采用适当的化学计量学和多元变量分析方法,提取丰富的特征代谢物信息,进行疾病的诊断与病理的分析。同时,数据预处理是代谢组学分析的关键步骤之一,尤其是数据归一化与标准化。如何选择合适的预处理方法已成为代谢组学数据处理研究热点 ...
温锦波
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