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Analysis of partial sequences of Hepatitis E virus isolated from human and swine in a certain area of Jiangsu province [PDF]
目的:调查了解江苏省某农村地区人源与猪源戊型肝炎病毒(HEV)的相关性。方法:应用逆转录-巢式聚合酶链法(rT-PCr)对同一地区内一般人群中HEV IgM阳性者、急性戊型肝炎患者血标本和生猪胆囊标本进行HEV rnA检测,并对HEV rnA阳性标本进行克隆测序和序列分析。结果:一般人群中检出的HEV基因1、4型比例相近,临床散发性戊肝病例绝大部分为HEV-4型病毒感染所致(95.24%);生猪胆汁标本PCr阳性率为12.11%,猪源HEV基因分型均为HEV-4型;分离于人和生猪的HEV ...
姜汉民 +7 more
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目的运用实时定量PCR(quantitative real-time,qRT-PCR)检测结核分枝杆菌蛋白Ag85B、38kDa及MPT64编码基因的表达水平,探讨结核分枝杆菌耐药菌株和敏感株,北京基因型和非北京基因型的蛋白抗原在转录水平的差异性及qRT-PCR诊断活菌的价值。方法根据Genbank提供的序列,设计目的基因fbpB、psts1、mpt64及内参基因Sigа的特异性引物,将扩增片段克隆入载体pMD18-T simple,重组质粒经纯化及倍比稀释,应用SYBR ...
陈伟 +7 more
doaj
Preliminary study on population genetic diversity of the little egret (Egretta garzetta) with microsatellite loci [PDF]
白鹭(Egrettagarzetta)是在全球分布广泛的湿地鸟类,曾被列入《濒危野生动植物种国际贸易公约》名单附录III(2003)。为对其遗传多样性等种群遗传学特征进行研究,本研究筛选获得用于白鹭种群遗传学研究的12个多态性微卫星位点,建立了白鹭羽毛的微卫星分型技术体系。在此基础之上,本文初步研究了中国沿海三个白鹭繁殖种群(广西防城港的巫头村、福建厦门猫屿、浙江舟山馒头山)2010年的种群遗传多样性和遗传结构。 微卫星筛选主要利用跨种扩增的方法,从黄嘴白鹭和棕颈鹭的已知位点中选择高多态性的位点进行扩增,
管昊
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目的通过对中国华东地区分离出的2株基因3型戊型肝炎病毒株进行同源性分析,探讨其分子起源和传播问题。方法收集华东某地区13个养猪场的133份猪粪便标本,利用巢式RT-PCR技术扩增戊肝病毒基因组的开放读码区2(ORF2)和RNA依赖的RNA聚合酶区(RdRp,ORF1),并进行基因同源性分析。结果戊肝病毒RNA检出率为43.61%(58/133)。其中,在同一个养猪场检出的2份阳性标本与23条戊肝病毒基因3型全长序列在ORF2和ORF1区的同源性分别为77.10%~92.64%和77.49%~91.14%,
夏宁邵 +5 more
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西北地区冠心病患者ApoE基因多态性分布研究以及对他汀类药物使用的指导意义 附视频
目的 探讨我国西北地区冠心病患者ApoE基因多态性分布情况。方法 选取西安交通大学第一附属医院冠心病治疗患者2 388例,检测ApoE的基因型,统计基因型及等位基因分布特征,并对比国内外其他地区基因型及等位基因分布差异。结果 E3E3、E3E4、E2E3、E2E4、E4E4、E2E2,分别占患者总数的70.31%、15.20%、11.93%、1.30%、0.75%、0.50%。检测出ApoE E2、E3及E4等位基因频率分别为7.12%、83.88%、9.00%。不同性别 ...
doaj +2 more sources
目的了解昆明3所医院临床分离的铜绿假单胞菌中超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)基因的分布情况。方法收集昆明3所医院临床标本中分离的铜绿假单胞菌110株,用VITEK32型全自动细菌鉴定仪进行细菌鉴定,用聚合酶链反应法对其进行基因检测,靶基因为TEM、SHV、OXA、PER、VEB、GES、CTX-M-1共7种ESBLs基因,对检测的阳性产物进行测序,并对照GenBank确定其基因型。结果 110株PA中7种主要的ESBLs基因型(PER、VEB、GES、TEM、SHV、OXA、CTX-M)均有检出 ...
王杨 +4 more
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吉林省地区朝鲜族和汉族健康人群醛固酮合酶基因(CYP11B2)-344T/C多态性分布的研究
目的分析我国吉林省地区朝鲜族和汉族健康人群醛固酮合酶基因(CYP11B2)-344T/C多态性的分布。方法应用聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)和限制性片段长度多态性(Restriction Fragment LengthPolymorphism,RFLP)技术,对67名朝鲜族和59名汉族健康人群CYP11B2基因多态性进行检测,并比较基因型和等位基因频率的分布特征。结果 67名朝鲜族中CYP11B2基因CC、TC和TT基因型频率分别为9%(6/67)、22 ...
刘行 +4 more
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Genotyping of Hepatitis C Virus with Probes Melting Curve Analysis [PDF]
病毒基因型是丙型肝炎抗病毒治疗方案选择的重要依据,常见的分型方法有测序分析、反向线性杂交、实时荧光PCR等,不同的方法设计各有优势和不足,本文建立了一个荧光PCR结合熔解曲线分析的丙型肝炎病毒(HepatitisCvirus,HCV)分型体系,用以区分中国大陆较常见的HCV1a、1b、2a、3a、3b、6a亚型。实验方法如下:一、制备6个内含HCVRNA核心区核酸序列的病毒样颗粒(HCV假病毒),分别作为6个HCV亚型的替代物/阳性质控品;二、设计通用引物扩增出HCV基因组的核心区 ...
谢晓婷
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目的构建检测冠心病(CAD)相关基因多重单核苷酸多态性(SNP)分型的方法。方法提取外周血白细胞DNA,选择CAD相关基因中国汉族人群的44个标签SNP,每个SNP设计3条引物,通过PCR扩增、延伸及杂交,应用SNP Stream基因分型系统对SNP位点进行基因分型。结果构建的44个SNP分型成功32个,分型成功率为72.7%(32/44)。通过对583份DNA标本进行检测,32个SNP的平均样本检出率为98.3%。结论本实验构建的32重SNP基因分型检测方法具有快速、准确、高通量、操作简单 ...
张阳东 +4 more
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OPN基因启动区-156delG多态性与中国HBV相关肝细胞癌的易感性
【目的】研究骨桥蛋白(OPN)基因启动区多态性与乙型肝炎病毒相关肝细胞癌(HBV-HCC)遗传易感性的关 系。【方法】225例确诊为HBV-HCC患者与200例年龄匹配的慢性乙型肝炎患者被纳入研究。OPN基因启动区3个多态性 位点(-156delG/G ,-443T/C和-616T/G)通过直接测序法确定基因型。【结果】HBV-HCC组-156 delG/delG基因型分布频率高 于对照组(P = 0.003)。HCC组-156 delG等位基因频率显著增高(P < 0.001 ...
时红, 吴元凯, 林国莉, 李向永
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