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浮萍(Landoltia punctata)基因组组装注释评估及其功能基因组初步分析
浮萍(Duckweed)是世界公认的、最小的、浮水生高等开花植物,其繁殖速度快并且具有独特的生理特性,在生物质资源和污水处理方面潜能非凡:浮萍以无性繁殖为主,可以通过诱导开花;能在特殊处理条件下,快速获得高淀粉积累;能在多种重金属水体环境下生长繁殖,并表现出优秀的重金属富集能力;能在多种生活污水中生长,并获得较高的淀粉和蛋白积累效果等研究都表明浮萍具有高度适应环境的能力和潜能,同时这些生理特征在浮萍亚科内在也表现出一定的差异。本实验室筛获了一株高淀粉积累少根紫萍,对于其优秀的生理特性和生物潜能应用 ...
李志丹
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MCP-1基因-2518A/G与GPx-1基因Pro198Leu多态性的交互作用与非酒精性脂肪性肝病的关系
摘 要: 【目的】 探讨单核细胞趋化蛋白-1(MCP-1)基因-2518A/G与谷胱甘肽过氧化物酶-1(GPx-1)基因Pro198Leu多态性的交互作用及其与非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的关系?【方法】 采用病例-对照研究的方法,以NAFL ?NASH ?NAFHC患者及健康对照者各600例的外周血白细胞为样本,利用聚合酶链反应(PCR)技术分析了MCP-1基因-2518A/G和GPx-1基因Pro198Leu多态性?【结果】 -2518A/G (GG)基因型和Pro198Leu (LL ...
张超贤
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二代测序技术及全基因组多样性比较是现代生物学及信息科学研究的热点,对基因组中转座元件(Transposable element)的分析已成为基因组比较分析的重要组成部分。目前对于转座元件的种类、数量和组成的挖掘和分析一般是基于完全拼接后的全基因组序列,对在此之前的海量短片段序列后期处理及拼接仍是目前基因组研究的盲点,以转座元件为主的重复序列在拼接过程中也存在着不可避免的拼接误差或丢失,给转座元件系统的分析带来不确定。文章旨在建立一套分析流程,对铜绿微囊藻NIES 843全基因组构建的罗氏(Roche ...
肖鹏, 李仁辉
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【目的】探讨载脂蛋白E(apolipoprotein E,ApoE)基因多态性与广州市中老年人群血脂水平的关系,以期为进一步研究提供基础和线索。【方法】采用等位基因特异性多重聚合酶链反应(ARMS-PCR)技术对624名40~65岁广州居民进行ApoE基因多态性检测,分析人群ApoE基因频率分布特点,并比较分析不同ApoE基因型血脂水平的关系。【结果】共检出6种基因型,以E3/3型最为常见,占67.95%,其次是E2/3和E3/4,分别占14.74%和13.62%,E2/4、E4/4和E2 ...
孙丽娜 +6 more
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小麦是全球食用人数最多、种植范围最广的重要粮食作物,被称为“世界性的粮食”。穗发芽( Pre- harvest sprouting,简称 PHS) 指小麦收获前遇到阴雨天气或潮湿环境下籽粒在穗上发芽的现象,是一种世界性的农业气候灾害。穗发芽是受遗传基因控制和环境因素影响的复杂数量性状。籽粒休眠特性与穗发芽密切相关,是影响小麦穗发芽抗性的主要遗传因素。国内外学者利用不同的遗传分析群体在多个染色体上鉴定了控制小麦籽粒休眠或穗发芽抗性的多个 QTL位点,并建立了与基因位点连锁的分子标记。近年来的研究表明 ...
王威
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目的探讨临床分离表皮葡萄球菌附属基因调节因子agr基因多态性,了解表皮葡萄球菌的分子特征。方法收集84株临床分离并经过全自动微生物鉴定系统准确鉴定的表皮葡萄球菌,通过PCR扩增esp和mecA基因准确鉴定和区分甲氧西林敏感表皮葡萄球菌(MSSE)和耐甲氧西林表皮葡萄球菌(MRSE),采用多重PCR扩增表皮葡萄球菌的agr等位基因,分析agr基因多态性。结果 84株临床分离表皮葡萄球菌中,20株为MSSE,占23.80%,其中agrⅠ型5株,agrⅡ型2株,agrⅢ型2株,agr未分型11株 ...
杨永长 +5 more
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进入21世纪后,由于人口、资源、环境等问题,直接影响了水稻的总产量,其远不能满足全球人口增加对稻米的需求。在过去的十几年中,水稻基因组研究取得了突飞猛进的进展,建立了致密的分子连锁图,定位了大量控制重要性状的主效和微效基因,基本完成了全基因组DNA序列的精细测定,功能基因组研究也已全面展开。中国通过水稻株型和优势利用选育的超级稻品种及其配套栽培技术研究在生产中发挥了重要作用。但是,要彻底解决全球粮食问题,我们还必须通过改善群体、理想株型育种、杂交优势利用、遗传工程、扩大遗传背景 ...
杨琼
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目的:采用多对型特异性引物,通过巢式PCR法检测厦门市乙型肝炎患者血清中乙型肝炎病毒(HBV)基因型的分布情况.方法:收集250例HBV感染患者血清,提取血清中HBV DNA作为模板,设计HBV前S1基因和S基因中区域内设计出10条内外引物,并将其中8条型特异性内引物分成A,B两组,分别扩增A,B,C和D,E,F型HBV,然后将第2轮PCR产物以用30g/L琼脂糖进行电泳,根据PCR产物电泳显示的产物长度判定HBV基因型,以了解厦门HBV基因型分布情况.结果:共120例确定了HBV基因型 ...
廉亚美 +7 more
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目的探讨白细胞介素-17F基因多态性与儿童支气管哮喘的相关性,为支气管哮喘的易感基因筛选提供可能的理论依据。方法取本院门诊随诊的60例哮喘患儿设为哮喘组,60例健康儿童设为对照组,两组儿童均于清晨空腹留取外周静脉血2ml,提取全基因组DNA,应用聚合酶链反应及克隆、基因测序方法分析IL-17F基因序列rs763780(H161R)基因多态性。结果 IL-17F基因序列rs763780(H161R)基因型在两组内均未检测到突变型CC,rs763780(H161R)基因型(TC/TT ...
赵宏霞, 刘瑜, 庄哈娜
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佳木斯地区原发性高血压合并高尿酸血症与MTHFR基因多态性的相关性研究
目的探讨MTHFR基因的基因多态性与原发性高血压合并高尿酸血症易感性之间的关系。方法选取符合要求的392例患者作为研究对象,其中对照组(n=102)、原发性高血压组(n=109)、高尿酸血症组(n=86)和原发性高血压合并高尿酸血症(n=95)。用DNA提取试剂盒提取入组人群的DNA,再通过聚合酶链反应-高分辨率溶解曲线(PCR-HRM)的方法进行基因分型,记录结果并分析原发性高血压合并高尿酸血症与MTHFR C677T基因多态性的相关性。结果在各实验组中,MHTFR C677T基因的CT ...
隋小芳 +8 more
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