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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2006 [目的]利用低密度基因芯片方法对人乳头瘤病毒（HPV）进行分型检测,建立一种经济实用的临床HPV感染的基因型检测方法.[方法]利用低密度基因芯片方法对145例阴道镜门诊病人的宫颈拭子标本进行HPV-DNA检测并分型.[结果]被检人群中共检测出57例HPV阳性,88例HPV阴性,HPV的感染率为39.3%,阳性标本中检测出12种高危型别,2种低危型别.其中单型感染51例（89%）,混合感染6例（11%）,16,31,18,58型检出率较高.[结论]低密度基因芯片是一种快速、简便、特异性强 ...
王敏 +4 more
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2007 【目的】基因芯片技术建立颅内动脉瘤患者血液单核细胞基因表达谱,筛选与信号传导相关的基因表达情况。【方法】50例颅内动脉瘤患者外周血,10例正常成人作为对照组,分离血液单核细胞,提取总RNA,与含22215个人类基因的Affymetrix寡核苷酸基因芯片杂交、洗脱、染色和扫描,分析检测的数据。荧光定量RT-PCR验证芯片结果。【结果】检测的22215个基因中,颅内动脉瘤共差异表达的基因有325个,差异水平均达2倍以上的基因有35个,生物信息学分析发现信号传导相关基因有7个,其中上调基因5个,下调基因2个。【
石忠松 +6 more
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血管紧张素转换酶、内皮型一氧化氮合酶和载脂蛋白E基因多态性与冠心病的相关性 [PDF]
Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2006 [目的]研究血管紧张素转换酶（ACE）基因插入/缺失多态性、内皮型一氧化氮合酶（eNOS）基因G894T多态性和载脂蛋白E（ApoE）基因多态性与冠状动脉粥样硬化性心脏病（冠心病）的关系.[方法]应用基因芯片技术分析133例冠心病患者和122例对照者ACE、eNOS和ApoE基因多态性,对比两组基因型及等位基因频率.[结果]冠心病组ACE DD基因型频率比对照组显著升高,28.6% vs 13.1%,P＜0.01,ACE基因多态性与冠心病危险性相关.两组eNOS和ApoE基因型频率差异无统计学意义（P ...
梁茜 +4 more
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2019 【目的】利用生物信息学的方法，对GEO和TCGA两个基因组学数据库进行分析，探究与前列腺癌相关的差异基因及相关的调控网络。【方法】综合GEO数据库的前列腺癌基因表达芯片数据（GSE46602、GSE55945）和TCGA数据库的RNA-seq数据，利用GEO2R及R语言的edgeR包进行基因差异分析，获得共同的显著差异基因，结合R语言的clusterProfiler包进行GO功能分析及KEGG通路分析，同时利用string网站进行蛋白互作网络分析，筛选出前列腺癌中调节蛋白表达量的关键基因 ...
李志标
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Study on the gene expression profile in the bone tissue in primary osteoporosis with kidney-yang deficiency syndrome [PDF]
, 2017 目的通过检测原发性骨质疏松症不同中医证型患者骨组织基因表达谱的差异,探讨原发性骨质疏松症肾阳虚证相关基因的信息学特征。方法随机选择原发性骨质疏松; 症患者,中医辨证分型为肾阳虚证组3例,肾阴虚证组3例,无肾虚证组3例,并选择正常骨密度人群3例设为正常对照组。用人全基因组表达谱芯片检测4组人群; 骨组织基因表达谱,筛选共同的差异表达基因,并对这些差异表达基因进行基因通路等相关功能分析。结果肾阳虚证组与正常对照组、肾阴虚证组、无肾虚证组的差; 异表达基因分别为2631条、3976条、6184条 ...
冯尔宥 +6 more
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Advancements of biochips and their applications(生物芯片及其研究进展)
Zhejiang Daxue xuebao. Lixue ban, 2001 生物芯片主要有两种类型，分别以分子微阵列和结构微阵列为基础，前者通过原位化学合成和芯片外合成机械点样法构建高密度的探针微阵列，主要用于DNA序列测定、分析基因组突变和多态性位点以及测定基因表达水平和比较同源基因在不同条件下的表达差异等；后者通过电子工业中标准的蚀刻工艺，在片基上构建各种显微结构微阵列，用于样品的分离及分子扩增等.本文阐述了生物芯片在概念、加工制备及应用领域等方面的研究进展.
XUBing-sen(徐炳森) +2 more
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Classification of Gene Expression Data Based on Dimension Reduction [PDF]
, 2015 利用基因芯片技术能够做到同时对多到数以万计的基因进行并行分析，随着该技术越来越成熟并得到广泛应用，现在已经有越来越多的基因表达数据测定出来，亟需处理，借助于计算机工具以及机器学习方法对这些大量数据进行分析是现在一个很重要的研究领域。其中，基因表达数据的分类研究是该领域的一个热点，通过分类能够帮助研究者发现正常细胞组织与疾病组织之间基因的本质差异，识别致病基因，对基因型疾病的临床诊断和治疗具有重要的意义。 基因表达数据具有“样本少、维数高、分布不平衡”的特点，这给分类带来了很多的困难和挑战 ...
李亮亮
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Marine flavobacterium Gramella flava JLT2011 utilization polysaccharide of phytoplankton and characterization of new species of Pelagibaca bacterium [PDF]
, 2015 海洋浮游植物是海洋食物网的初级生产者，是海洋有机质重要分泌者。海洋浮游植物光合作用产生的有机质,通过海洋细菌分泌的一系列胞外酶等将颗粒有机质POM（ParticleOrganicMatter,POM）进一步代谢为生物可利用的溶解有机质（BioavailableDissolvedOrganicMatter,BDOM）。在这一个过程中噬纤维菌-黄杆菌-拟杆菌(Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroides,CFB)菌群起着重大的作用。这类细菌形态多样，一般具有较强的运动性和粘附性 ...
林颖芳
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Association between polycystic ovary syndrome and environmental endocrine disruptors: the pathogenetic mechanisms involved [PDF]
, 2016 摘要 多囊卵巢综合征(Polycysticovarysyndrome，PCOS)是一种在育龄妇女中常见的内分泌紊乱疾病，其常见特征为稀发排卵或少排卵、高雄激素血症、卵巢多囊化。PCOS的发病机制尚不明确，而许多研究表明环境因素是导致PCOS发病的重要因素。 本实验收集育龄妇女流行病学资料，并利用气象色谱-质谱联用检测了84名PCOS患者及94名对照组血清中多种环境中内分泌干扰物(endocrinedisruptingchemicals，EDCs)的含量。结合流行病调查资料和相关激素代谢物质水平 ...
郭致准
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Data Analysis of Expression with Gene Microarray and Investigation for Gene Regulatory Networks [PDF]
, 2017 基因芯片表达数据可以揭示在各种不同条件下基因的活动情况及基因之间相互作用关系等，因此，对该数据的分析有着非常广泛的应用前景。近年来，随着基因芯片表达数据快速增长，传统的分析方法已经不能适应现代生物迅速发展的要求，迫切需要更加高效的方法来分析处理这些数据。 本文首先简述了基因芯片表达数据分析的关键技术及其研究进展，指出了现有方法存在处理冗余和噪声数据能力不足、结果缺乏生物学解释以及调控网络识别率有限等问题。针对这些问题，我们研究了基因芯片表达数据分析三种新方法，包括：基因芯片表达数据的特征选择方法 ...
郭顺
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