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Research on Gene Chip Image Segmentation Algorithm Based on Deep Learning [PDF]
, 2017 基因芯片是由数千个基因点组成的一个微阵列，它是一项能够分析基因表达的技术。通过基因表达不仅可以探索人类疾病的潜在遗传原因，还可以应用在环境卫生研究、药物研制与开发、临床诊断和治疗以及癌症检测。基因芯片图像处理在基因表达分析中是一个极其关键的环节，处理的结果直接影响到准确率和精度。基因芯片图像处理主要包括预处理、网格定位、靶点分割和信号提取与分析。本文主要工作围绕以下几点展开： 首先，通过对基因芯片图像预处理分析不同基因点的特征，对其进行灰度转换，对比度增强、滤波去噪等处理进而网格定位 ...
上官亚力
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肝炎基因诊断芯片同时检测慢性乙型肝炎患者血清及肝组织HBVDNA的临床研究
Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2003 目的 用肝炎基因诊断芯片同时检测乙型肝炎患者血清及肝组织中HBVDNA ,并与雅培试剂、免疫组织化学和原位分子杂交法比较。方法 用点样仪将PCR扩增的HBCDNA探针点到特殊处理过的玻片上制成基因芯片 ,对 15例慢性乙型肝炎患者的血清及肝活检组织 ,分别用基因芯片、原位分子杂交法、免疫组织化学法、雅培试剂检测HBVDNA、HBcAg、HBsAg、HBeAg .结果 15例HBsAg、HBeAg阳性的乙型肝炎血清 ,基因芯片检测均阳性。 15例肝组织标本 ,免疫组化法阳性 15例 ,原位分子杂交阳性 ...
赵伟 +5 more
doaj
Application of NIR photothermal nanomaterials in cancer theranostic and their safety assessment [PDF]
, 2016 近年来，纳米材料合成技术的发展，尤其在可控合成方面的突破，使得纳米材料在生物传感、分子影像、药物控制释放及肿瘤治疗等生物医学领域中展现了广泛的应用前景，并逐渐形成纳米医学的学科分支。设计和制备兼具诊断和治疗功能为一体的纳米诊疗试剂已成为当前研究的热点。如何利用可控合成技术制备新型诊疗试剂并发展模型材料体系进行纳米材料的系统生物学行为研究仍然是纳米生物医学的挑战。因此，本论文重点研究了超薄二维纳米材料的尺寸控制和表面修饰对肿瘤诊疗及生物安全性的影响，并初步构建了纳米生物体系的构--效关系。基于以上研究 ...
陈美
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2013 目的探讨PCR-膜芯片技术直接应用于痰标本中结核杆菌耐药基因突变检测的可行性。方法采集82例痰标本（结核患者64例,非结核患者18例）,TB膜芯片检测标本中的结核杆菌IS6110基因,阳性者利用12对特异性引物进行多重PCR,扩增产物与含有59个探针的耐药-TB膜芯片反向点杂交检测结核杆菌耐药基因突变,测序验证并与药敏试验比对。结果 TB膜芯片检测痰标本中的结核杆菌IS6110基因,特异度为100%（18/18）,灵敏度为81.3%（52/64）,阳性预测值为100%（52/52）,阴性预测值为60 ...
谭景尹 +8 more
doaj
hsa-miR-125a-5p Enhances Invasion Ability in Non-Small Lung Carcinoma Cell Lines [PDF]
, 2009 Background and objective MicroRNAs (miRNAs) are short non-coding RNAs that posttranscriptionally regulate gene expression by partially binding complementary to target sites in mRNAs.
Enhua WANG +4 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2014 目的评价基因芯片技术在结核病防治工作中对结核分枝杆菌异烟肼和利福平耐药性的检测效果。方法利用基因芯片技术对38例涂阳肺结核患者的痰标本进行异烟肼和利福平耐药检测,以传统罗氏药敏试验为金标准,对基因芯片技术的检测效果进行评价。结果在38例菌株中,用基因芯片法进行异烟肼耐药基因检测,与罗氏药敏的符合率为84.2%,对38例进行利福平耐药基因检测,符合率为89.5%。结论基因芯片检测异烟肼和利福平的耐药性与罗氏药敏方法具有很好的一致性,具有简便快速,灵敏度高,特异性好的优点 ...
孙炳奇 +4 more
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The association between the antioxidant property and ROS system in murine corneal epithelial progenitor cells [PDF]
, 2016 目的：活性氧（ROS）是体内产生的一种高活性分子，低浓度可以调节细胞代谢，基因转录和磷酸酶的活性，高浓度则会导致氧化损伤。目前，有关干细胞自身特性的研究越来越受到学者们的重视，但既往文献中关于干细胞对氧化应激反应以及应激条件下细胞内相关酶活性的变化规律却很少报道。本课题聚焦于，在过氧化氢（H2O2）诱导的氧化应激条件下，活性氧生成关键因子NOX4和抗氧化酶核转录因子NRF2在小鼠角膜上皮祖细胞（TKE2）和成熟的小鼠角膜上皮细胞（MCE）中的不同作用及相关机制。 方法：利用小鼠角膜上皮祖细胞（TKE2 ...
周晶
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2010 目的利用基因芯片筛选与精子发生相关的基因,并研究其表达特征。方法将4 d、9 d、18 d、35 d、54 d和6月龄小鼠睾丸组织cDNA与Affymetrix全基因组芯片进行杂交,筛选出差异表达的基因。通过RT-PCR分析差异表达基因在小鼠睾丸不同发育阶段中的表达。结果分析Affymetrix全基因组芯片杂交结果后,筛选得到1个差异表达杂交点,通过在NCBI网站与小鼠全基因组序列Blast分析可知该差异表达基因是Rfx2基因。该基因在4 d、9 d、18 d、35d、54 ...
王朝亮 +7 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2022 目的 探讨膀胱癌发病的关键基因以及发病机制通路。方法 通过GEO数据库搜索膀胱癌基因芯片测序结果，计算机R语言（limma数据包）对测序原始数据进行均一化处理，GEO2R检测差异基因，通过芯片融合分析锁定共同发病基因。使用最新版本生物信息学分析对膀胱癌测序结果进行数据挖掘，包括DAVID基因转换、基因本体分析、KEGG信号通路分析，STRING蛋白互作分析，Cytoscape可视化处理，cytohubba筛选膀胱癌关键基因。结果GSE61615包含2例膀胱癌组织和2例癌旁正常组织 ...
邢晨 +4 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2011 目的建立一种运用多重PCR方法结合基因芯片技术快速、准确检测11种常见致病菌的方法。方法筛选志贺氏菌、肠炎沙门氏菌、伤寒沙门氏菌、大肠杆菌O157、副溶血性弧菌、普通变形杆菌、蜡样芽孢杆菌、金黄色葡萄球菌、单核细胞增生李斯特菌、产气荚膜梭菌、空肠弯曲菌的特异基因作为目的基因。设计相应的引物及探针,进行多重PCR扩增,制备寡核苷酸芯片。将多重PCR扩增产物与带有11种特异探针的基因芯片杂交。用扫描仪扫描,判定细菌种类。结果该基因芯片可特异性地检测11种致病菌,具有良好的特异性,基因组DNA检测灵敏度可达2×
贺晨 +5 more
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