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Differential expression of microRNAs between LESCs and SESCs and pilot study of their functions [PDF]

open access: yes, 2014
目的:通过基因芯片技术找出角膜上皮干细胞和皮肤上皮干细胞差异性表达的microRNAs并对其在增殖和分化方面的功能及作用机制进行初步的研究和探讨。 方法: 1. 运用克隆培养方法分别培养三组人角膜和皮肤上皮干细胞,进行microRNA基因芯片分析,找出有显著差异性表达的microRNA(p≤0.05差异倍数≥1.5)。 2. 对基因芯片分析出的差异性表达的microRNA进行荧光实时定量PCR,筛选出表达模式与芯片结果一致并且差异倍数较大的microRNA。 3.
杜慧怡
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Screening and Cloning the Heavy Metal Tolerance-associated Genes in Avicennia marina (Forsk.) under Cadmium stress by Suppression Subtractive Hybridization [PDF]

open access: yes, 2015
白骨壤(Avicenniamarina)作为红树林的先锋树种,广泛分布于海岸河口的低潮带,其独特的生物学和生态学特性为探索红树植物对重金属耐受性的分子机理提供了最佳的研究对象。红树林生态系统虽然承受大量重金属污染物胁迫,但对重金属污染物却表现出很强的耐受性和抗性,其中白骨壤对重金属的耐受性较其他红树植物更为突出。本研究以红树植物白骨壤为材料,研究重金属污染物镉(Cadmium)胁迫下的白骨壤幼苗基因表达差异,寻找与重金属耐受性相关的候选基因,并为红树植物的基因组研究建立相关的基因文库 ...
张骥诚
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结核杆菌蛋白芯片检测对活动性肺结核的诊断价值

open access: yesZhongguo shiyan zhenduanxue, 2010
目的评价结核杆菌蛋白芯片对肺结核的诊断价值及其影响因素。方法对痰涂片阳性肺结核病患者结核杆菌蛋白芯片和胸部CT扫描结果进行对比,分析肺结核病变范围和类型等因素对结核杆菌蛋白芯片检测的影响。结果结核杆菌蛋白芯片阳性率72.0%,CT诊断阳性率为90.0%,两种方法同时检测阳性率达到96.0%;多个肺野肺结核的结核杆菌蛋白芯片阳性率高于单个肺野 ...
曹军皓, 黄前川, 赵冰红
doaj  

Scanning of immune relevant genes from Pseudosciaena crocea and characterization of RPL10/QM-like gene from two sciaenoid fishes [PDF]

open access: yes, 2009
本研究以石首鱼科大黄鱼(Pseudosciaenacrocea)为研究对象,利用基因芯片和Real-time等技术筛选了大黄鱼免疫相关基因,研究了大黄鱼核糖体蛋白L10(RPL10/QM-like)基因及其表达产物,同时研究了大黄鱼亲缘种眼斑拟石首鱼(Sciaenopsocellatus)的RPL10/QM-like基因,研究结果充实了石首鱼类免疫学研究内容,也为鱼类的进化研究提供有价值的参考资料。主要结果如下: 1、 病原菌的鉴定 本研究从患病中华乌塘鳢中分离出两种病原菌,经过回归感染,再次分离 ...
陈心
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AQP4与先天性脑积水的相关性研究

open access: yesZhongguo shiyan zhenduanxue, 2017
目的研究AQP4在脑积水鼠中的遗传规律,探讨其在脑积水中的作用。方法随机选择未脑积水AQP4敲除雄鼠与AQP4敲除雌鼠交配,用其F1、F2、F3代建立遗传图谱,研究其遗传规律。提取大脑组织总RNA,制作基因芯片研究其在遗传中的作用。结果 AQP4基因敲除表型的是可遗传的且与性别无关,同时并非单基因遗传,且为常染色体遗传;小鼠全基因芯片表明在AQP4敲除的背景下脑积水表型的发生有其它遗传基因的参与。结论通过制作遗传图谱以及小鼠基因芯片,证明AQP4在先天性脑积水发病机制中有重要的作用。
乔小放   +6 more
doaj  

Analysis of gene expression patterns based on microarrays [PDF]

open access: yes, 2007
基因芯片含有寡核苷酸探针或者cDNA探针,用来在一次实验中同时测量成千上万个基因的表达水平。基因表达模式分析系统(GEPS:theGeneExpressionPatternScanner)是一个在线的交互式基因芯片数据分析平台,可对基因表达谱进行相关性分析,相似性分析和特异表达分析。这些分析模式是利用空间几何,相关性分析的方法,系统地、全局地鉴定的,并且有图形化和量化显示。用户可以设置分析时的阀值。另外,为了更好地理解基因表达模式 ...
王玉鹏
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鼻咽癌差异表达miRNAs筛选研究

open access: yesZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2007
【目的】应用miRNAs芯片筛选原代培养的鼻咽癌细胞差异表达miRNAs,并寻找差异表达miRNAs调控的靶基因,为进一步研究其在鼻咽癌发病机制中的作用打下基础。【方法】运用miRNAs芯片技术筛选原代培养的鼻咽癌细胞差异表达miRNAs,同时运用miRNAs特异的引物组对差异表达的miRNAs进行荧光定量RTPCR验证。运用靶基因预测软件并结合全基因组表达谱芯片结果预测差异表达miRNAs可能调控的靶基因,并利用westernblot技术检测预测的靶基因在原代培养的鼻咽癌细胞中的表达。【结果 ...
李晓霞   +4 more
doaj  

Genome-Wide Detection of Tissue-Specific Genes & Database Construction [PDF]

open access: yes, 2010
组织特异表达基因(Tissue-SpecificGene)是指在某一种或少数几种组织或细胞中特异表达的基因。研究组织特异表达基因有助于我们更好地理解组织和基因的关系,有助于我们找到疾病的发病原因,同时有助于我们发现新的组织特异的药物靶点。 目前已出现不少研究组织特异表达基因的方法,包括传统的实验方法、高通量实验方法以及生物信息学方法。在使用生物信息学方法研究组织特异表达基因领域,虽然已经有了组织特异表达基因的数据库,例如GEO,ArrayExpress,TiGER,BODYMAP ...
肖生建
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[Interferon-related gene array in predicting the efficacy of interferon therapy in chronic hepatitis B]. [PDF]

open access: yesSheng Wu Yi Xue Gong Cheng Xue Za Zhi, 2023
Wang J, Lu J, Zhou C, Du L, Tang H.
europepmc   +1 more source

The bioinformatics research of gene’s pausing and APA [PDF]

open access: yes, 2015
近年来,生化技术的不断优化以及二代测序的使用使得我们对基因的转录调控有了新的认识,尤其是在真核生物中聚合酶II的转录行为有了更为深入的了解。就目前的报道,我们知道聚合酶II在基因近端启动子的停留确定是转录过程中的限速步奏,同时也是对外界刺激的快速应答的调控方式,对细胞的增殖,发育等许多方面有着重要的作用,而就其调控基因的具体数量以及基因状态从未研究过。 高通量技术的应用过程中,我们发现在基因的3’UTR区域的可变聚腺苷酸化(APA)也是转录过程中重要的调控节点 ...
余斌
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