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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2012 目的建立寡核苷酸探针正向斑点杂交技术,快速筛选不同细胞株同一基因HIF-1a表达差异,探讨斑点杂交筛选基因表达的可行性。方法将多种培养肿瘤细胞株提取总RNA后,点样于尼龙膜上,与地高辛标记的HIF-1a基因探针杂交,结果与半定量RT-PCR结果比较。结果斑点杂交实验结果与RT-PCR结果一致,无统计学差异（P>0.05）。结论用随机引物地高辛标记DNA探针可以快速筛查不同细胞株同一基因表达差异,可以作为研究肿瘤基因表达差异的工具。
汪永强 +5 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2023 目的 基于微阵列数据分析筛选中国人冠心病(CHD)的关键基因和信号通路，以期为临床探究潜在的发病机制与治疗靶点。方法 以CHD为检索关键词从基因表达图谱(GEO)数据库下载GSE71226微阵列芯片数据进行进一步分析，利用R Studio软件中“limma”包筛选冠心病患者与正常健康人群的差异基因并对其进行可视化处理，利用R Studio软件中“clusterProfiler”包和“org.Hs.eg.db”包对差异基因进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析 ...
王星 +5 more
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STAT4基因rs10181656位点的多态性与不明原因复发性自然流产的相关性
Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2017 【目的】探讨信号转导与转录激活因子4（STAT4）基因在不明原因复发性自然流产（URSA）表达及其表达量与 rs10181656位点多态性的关系。【方法】分别采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性法检测332名URSA患者和260名健 康对照者rs10181656位点的基因型频率；应用免疫组织化学技术检测其中的86名URSA患者及77名健康对照者蜕膜STAT4 基因的蛋白表达量。【结果】rs10181656C/G：URSA组中C/C、C/G及G/G基因型频率分别是36.45％、46.99％及16 ...
李银广 +3 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2010 目的探讨大肠肿瘤p53和ki-ras基因协同突变的临床意义。方法采用免疫组化和PCR-SSCP方法,检测58例大肠肿瘤患者的良性病变、良性病变转为恶变、原发腺癌组织的p53基因、ki-ras基因的表达和突变情况。结果良性病变组与恶变组间的p53基因和Ki-ras基因的表达有显著差异,良性病变组与原发腺癌组的Ki-ras基因表达差异显著;良性病变组的p53基因与Ki-ras基因的表达呈负相关,而恶变组和原发腺癌组呈正相关。p53基因和ki-ras基因两种基因突变率无显著差异,而协同突变与淋巴结转移密切相关,
侯睿哲 +3 more
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野生动物学报, 2018 旨在研究不同生长时期东北梅花鹿茸生长中心软骨组织基因表达变化,为鹿茸快速生长机制研究提供理论依据。采用Illumina测序技术和生物信息学方法对快速生长期和骨化期鹿茸生长中心软骨组织进行转录组测序、组装、比对和差异基因表达分析。从快速生长期和骨化期鹿茸软骨组织中分别获得4.47和4.45 Gb的测序数据,测序质量值Q20值分别为98.44和98.05。通过Trinity软件组装,分别获得39377和37331条组装序列,平均长度分别为1138和1143 nt ...
刘美欣 赵 雨 张 梅 刘宇昕 胡耀中 幺宝金
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浙江大学学报. 医学版目的借助生物信息学技术探究骨质疏松中铁死亡的基因靶点并利用体外实验验证骨质疏松中铁死亡关键基因，探讨铁死亡在骨质疏松中的作用机制。方法在基因芯片公共数据库中筛选骨质疏松相关基因数据集GSE35958并进行数据矫正分析；在FerrDb数据库中筛选铁死亡相关基因，并与数据集GSE35958差异表达基因取交集得到骨质疏松中铁死亡相关差异表达基因，然后进行差异表达基因的基因本体（GO）与京都基因和基因组数据库（KEGG）富集分析；分析差异表达基因的Spearman相关系数，并绘制蛋白质-蛋白质相互作用网络 ...
夏 玉双 +6 more
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[Screening, functional analysis and clinical validation of differentially expressed genes in diabetic foot ulcers]. [PDF]
Zhonghua Shao Shang Yu Chuang Mian Xiu Fu Za Zhi, 2022 Wang P +5 more
europepmc +1 more source
Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2008 目的筛选与精子发生相关的睾丸特异性新基因。方法将不同发育阶段的小鼠睾丸组织cDNA探针与Affymetrix全基因组芯片进行杂交,通过杂交信号的比较,筛选出差异表达的基因。用生物学信息软件对该基因进行生物学信息分析。RT-PCR分析该基因在小鼠不同发育阶段睾丸、小鼠不同组织及人不同组织中的表达。结果通过4、9、18、35、54日龄和6月龄小鼠睾丸的芯片信号比较筛选出一个差异表达基因（GenBank登录号:XM-156106）,全长有1364 bp,含有1146 bp的完整ORF,编码一个有381个氨基酸、
余振东 +7 more
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基于RNA-Seq技术的野生和圈养塔里木马鹿皮肤组织转录组比较分析
野生动物学报, 2023 为探寻野生和圈养塔里木马鹿（Cervus elaphus yarkandensis）的基因表达谱是否存在差异，并进一步筛选该物种适应干旱环境的相关基因，利用RNA-Seq技术对野生和圈养塔里木马鹿的皮肤组织进行转录组测序，对测序数据质控后比对参考基因组，筛选差异表达基因并对其进行功能注释和富集分析，利用qRT-PCR方法对转录组测序结果进行可靠性检测。结果显示：与圈养塔里木马鹿相比，在野生塔里木马鹿皮肤组织中共有3 303个差异表达基因，包括上调表达基因1 535个，下调表达基因1 768个 ...
布威海丽且姆·阿巴拜科日 +3 more
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染色体22q12上THOC5和ADRBK2基因在人脑胶质瘤组织中mRNA表达
Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2010 目的观察位于染色体22q12上的THOC5和ADRBK2基因在人脑胶质瘤肿瘤组织中mRNA表达。方法应用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）及图像分析方法,检测17例人脑胶质瘤肿瘤组织和8例正常人脑组织中THOC5和ADRBK2基因mRNA表达。基因表达水平用THOC5或ADRBK2基因/β-肌动蛋白（β-actin）灰度比值×100表示。结果ADRBK2基因在正常人脑组织和人脑胶质瘤肿瘤组织中,均存在弱表达,统计分析显示无显著性差异（P>0.05）;THOC5基因在正常人脑组织中弱表达 ...
田宇 +6 more
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