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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2017 【目的】通过生物信息学的方法发现特发性肺纤维化（IPF）的致病基因并为进一步研究提供靶点。【方法】从 GEO数据库中下载基因芯片数据集GSE53845、GSE24206、GSE10667，并使用GEO2R分析工具筛选出正常组织与IPF的差异 表达基因。在DAVID数据库中对差异表达基因进行GO分析和KEGG通路富集分析，以便找到IPF发病过程中差异表达基 因主要参与的生物功能及其集中的信号通路。为了研究差异表达基因与蛋白之间的作用关系，使用 STRING 和 CYTO ...
黄鑫炎, 郭禹标
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Transcriptome and Proteome Analysis During Larval Settlement and Metamorphosis in Fujian Oyster(Crassostrea angulata) [PDF]
, 2016 附着变态衔接浮游阶段与底栖阶段，是海洋无脊椎动物生活史的重要环节，附着变态过程涉及到复杂的生理过程和行为形态的改变，人们至今未能很好地阐释其中涉及到的分子机制。福建牡蛎（Crassostreaangulata）是我国南方主要的贝类养殖种之一，具有典型的附着变态过程。然而关于牡蛎附着变态过程的分子研究停留在个别基因的克隆和定量表达的研究，这并不能反映附着变态过程的多基因的调控网络。有大量的药理学研究表明肾上腺素能够诱导牡蛎幼体未经附着而直接变态，但是肾上腺素诱导的分子机制的研究至今空白。本研究采用转录组学、
肖小伙
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Study on factors affecting fruit development of seedless ponkan cultivar Huagan No.4 [PDF]
[Objective] Ponkan (Citrus reticulata Blanco.) is one of the main Mandarins cultivars in China. Huagan No.4 is a new seedless cultivar selected from a bud sport of Jing'an ponkan, with improved fruit quality. However, the cultivar has the problems of low
CHAI Lijun +11 more
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基于生物信息学途径探究载脂蛋白 H 在肝衰竭中的功能及作用机制 [PDF]
, 2020 【目的】通过生物信息学方法，分析在肝衰竭中高表达的载脂蛋白H（APOH）在疾病发生发展中的功能与机制。【方法】从GEO数据库下载多个芯片数据集（GSE14688、GSE38941和GSE96851），以5筛选出差异表达基因，通过Cytoscape及R对前10位关键基因中的APOH基因进行GO生物学功能富集分析和KEGG信号通路分析，并进一步在慢乙肝相关肝衰竭组织中进行表达验证。【结果】共筛选出2438个差异表达基因，其中，1162个上调基因，1276个下调基因 ...
于明雪 +6 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2007 目的探讨β-连环蛋白（β-cat）在卵巢癌组织中的表达及意义。方法①应用4097点基因芯片对5例卵巢癌及5例正常卵巢组织进行基因表达谱分析,筛查差异表达基因。②对60例卵巢癌组织、24例卵巢瘤组织及24例正常卵巢组织石蜡标本进行免疫组织化学方法染色,检测β-cat的表达情况,分析β-cat的表达与临床分期及组织分级的相关性。结果①基因芯片筛查出卵巢癌差异表达基因58个,其中基因表达增高（上调趋势）30个,基因表达降低（下调趋势）28个,β-cat为表达增高基因。②β ...
张晓霞 +4 more
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Relationship between postmenopausal osteoporosis and immune function by high - throughput sequencing [PDF]
, 2017 目的：探讨绝经后骨质疏松与免疫功能的关系。通过寻找绝经后骨质疏松组与非骨质疏松组两组间的差异表达基因，并对这些差异表达基因进行功能富集分析。通过它们参与的信号通路来研究绝经后骨质疏松与免疫功能的之间关系。 方法：选取6名符合实验要求的绝经后病人。双能X线吸收仪测定股骨颈或腰椎骨密度T值-1标准差，符合该标准的3名纳入对照组。于空腹抽取肘静脉血适量，提取外周血单核细胞RNA。Nanodrop分光光度计及琼脂糖电泳对RNA进行质检，构建RNA文库。进行桥式扩增，用IlluminaHiseq2000平台测序 ...
陶有娣
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Genetic Fingerprint Concerned with Lymphatic Metastasis of Human Lung Squamous Cancer [PDF]
, 2009 Background and objective With the most recent introduction of microarray technology to biology, it becomes possible to perform comprehensive analysis of gene expression in cancer cell. In this study the laser microdissection technique and cDNA microarray
Li CHEN +7 more
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Differences between roots and leaves of Semiliquidambar cathayensis by transcriptiomic analysis [PDF]
[Objective] Both the roots and leaves of Semiliquidambar cathayensis have the effect of dispelling wind and removing obstruction in the meridians, but they are different in active components such as flavonoids.
HUANG Ritao, WEI Yudan, ZHOU Yun
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2006 【目的】比较不同区域猪晶状体上皮细胞的基因表达在转录组水平上的差异。【方法】解剖显微镜下分离晶状体前囊膜, 将附着于其上的上皮细胞分为中央( 直径为 10.56 mm) 和周边两部分。分别提取两个样本的总 RNAs 并经 PCR 扩增, 以 Cy3 和 Cy5 分别标记扩增的中央与周边部分的 cDNA, 与含 7548 个基因的表达谱芯片杂交, 经图像分析, 生物信息学处理获得基因表达在转录水平差异的相关信息。【结果】中央与周边区域的猪晶状体上皮细胞在转录组水平共鉴定出952个有效表达的基因点 ...
吴明星, 张艳莉, 吴开力
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肾透明细胞癌Caki-1细胞系差异表达基因的生物信息学分析 [PDF]
, 2018 目的比较肾透明细胞癌Caki-1细胞系与正常肾上皮细胞系ASE-5063中的差异表达基因(DEGs),寻找潜在的肾透明细胞癌特异性分子标志物。方法利用GEO数据库自带的GEO2R在线分析工具分析基因芯片GSE78179,将筛选出的DEGs分别导入Metascape、STRING以及Cytoscape进行综合分析并筛选出核心基因。最后使用Fun Rich等软件对筛选出的核心基因进行GO和KEGG富集分析。结果共筛选出562个DEGs,其中上调基因345个,下调基因217个 ...
朱合欢 +5 more
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