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野生动物学报, 2006 粪便DNA提取的质量与动物的取食、样品采集地的环境温度、粪便的保存方法有着密切的关系。对于含纤维素较高的食物通过动物的肠道时会有较多的肠道细胞脱落,因此可以提高样品中DNA的含量;当样品采集地的环境温度较高时容易使粪样中的DNA降解,将会降低样品中DNA的含量;然而生活在不同生境类型内的动物,应采取不同的粪便保存方法,这样可以提高样品的质量。在粪便DNA提取方法中,常规法是一种简单、省时、经济的方法。随着粪便DNA分析技术的发展,这项技术在将来的濒危物种遗传结构的研究中会得到广泛的应用。
刘艳华, 张明海
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野生动物学报, 2022 动物在生长发育不同阶段组织器官的代谢水平有所差异,线粒体DNA(mtDNA)的拷贝数在一定程度上反映了机体的生理状态和代谢强度。以64只大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)粪便DNA为材料,采用实时荧光定量PCR方法,验证了肠道上皮组织中平均每个细胞mtDNA的拷贝数(Nmpc)与月龄之间具有显著相关性(R2=0.129,P=0.004),且呈现出随着月龄的增长而下降的趋势。幼龄个体的Nmpc远高于中、老龄个体,且个体差异很大。此外,性别对Nmpc也具有明显的影响 ...
任晓彤 +7 more
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野生动物学报, 2011 现有的粪便DNA提取方法通用性不好,DNA纯度不高不适用于白头鹤等水鸟,本研究探索一种改进的硫氰酸胍裂解法。通过线粒体DNA细胞色素b、控制区基因和微卫星DNA的PCR扩增及线粒体DNA控制区序列的测定,经琼脂糖凝胶电泳检测以及测定序列显示,提取的DNA模板纯度高,效果很好,证实改进方法的可靠性、有效性。为其他濒危水鸟的非损伤取样提供了新的材料和方法,为其保护遗传学的研究提供一定的新技术。
代艳丽, 周立志
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野生动物学报, 2010 利用黑尾鹿、白尾鹿等近缘物种的18对微卫星引物,对2个东北马鹿肌肉DNA样品和176个粪便DNA样品进行扩增,通过毛细管电泳法筛选适合东北马鹿的微卫星位点。结果表明,其中3个位点为高度多态性位点（PIC>0.5）,1个为中度多态性位点（0.5>PIC>0.25）。共检测到26个等位基因片段,平均每个位点6.5个等位基因。多态信息含量0.393～0.827,个体识别率0.643～0.958,累积个体识别率为0.9999,累积非父排除率为0.9976。这4个多态性微卫星位点为东北马鹿的遗传研究提供了理论依据。
张辉, 张明海, 罗理扬
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野生动物学报, 2007 目前,栖息地的破坏是野生动物处于濒危状态的主要因素之一。东北马鹿是国家重点保护动物,近年来,人类活动的干扰使其生境明显减少并呈斑块状分布,这将使东北马鹿的种群遗传结构发生变化。然而,在野生动物遗传结构研究中,传统的取样方法直接或间接地对动物造成了伤害。因此,本文以粪便为研究材料,对来自完达山地区的9个东北马鹿样品进行mtDNA序列分析,共发现29个变异位点,定义了7个单倍型,其单倍型多样性（h）平均值为0.917、核苷酸多样性（π）平均值为2.803,种群总体遗传多样性较高 ...
刘艳华, 张明海
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野生动物学报, 2020 利用粪便DNA技术对候鸟进行物种鉴定，对了解鸟类在繁殖地和越冬地的种类分布、研究其迁徙路线等具有重要意义。本研究扩增、测定了76份雁形目鸟类粪便的D-loop区序列，将其与NCBI数据库中已知鸟类同源序列进行比对分析（BLAST比对法）。结果表明：相似度为98.07% —100%，其中75%的单倍型可以被认定为单一物种，25%的单倍型检测为非单一物种，即包含2个近缘物种。比较基于Ts、Ts +Tv碱基替换计算的K2P遗传距离，说明后者更适合于D-loop区序列特征。而且，以此为基础的遗传距离法 ...
秦啼 1 +5 more
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野生动物学报为了解大熊猫（Ailuropoda melanoleuca）肠道脱落细胞中线粒体DNA（mtDNA）的异质性特点及其与年龄的关系，以92只不同年龄的大熊猫粪便为材料，通过扩增子高通量测序研究非编码的D-loop区、编码rRNA的16S rRNA区以及编码蛋白质的ND1和ND2区的异质性。结果显示：D-loop区存在3个异质性热点区段，突变碱基的数量远远高于其他3个编码区；D-loop区TS/TV小于16S rRNA和ND两个编码区，表明后两者较D-loop区受到更强烈的纯化选择 ...
李晓达 +8 more
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野生动物学报野生动物食性研究是掌握动物生境需求的核心内容，对野生动物的保护和管理具有重要意义。在我国辽东湾斑海豹（Phoca largha）传统繁殖地和盘锦栖息地海域采集其粪便，选用12S rRNA作为分子标记进行粪便DNA扩增，利用高通量测序鉴定其食物组成。结果发现：在斑海豹粪便中共鉴定出鱼类16种，隶属5目8科13属。食物组成的相对丰度显示：梭鱼（Liza haematocheilus）为绝对优势的饵料食物（40.72%），其次为鰕虎科（Gobiidae）种类（23.18%）。属水平不同采样群体的相对丰度显示 ...
高祥刚 +5 more
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野生动物学报, 2014 为了解野生天山马鹿哈密种群的微卫星多态性,本文选用5 对微卫星标记引物,利用粪便DNA分析法、PCR 和复合电泳银染技术,通过计算基因频率(P)、有效等位基因数(Ne)、群体杂合度(He)、多态信息含量(PIC)和遗传距离,对冬季采集的201 份天山马鹿粪便进行了研究,评价了其遗传多样性和系统进化分析。结果表明:成功提取DNA的194份粪便分属140个体; 种群平均等位基因4.200±0.837; 平均有效等位基因数3.2167±0.0236; 平均多态信息含量0.6332±0.0017 ...
夏米西丁·阿不都热依木 艾斯卡尔·买买提 布左拉·吐尔逊孜拉吉古丽·西克然木 阿依努尔·阿卜杜艾尼 马合木提·哈力克
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野生动物学报, 2020 为了探究在不同生活环境的天鹅肠道菌群的差异，我们从3个地点收集了4组天鹅的粪便样品，A组样品来自河南农业大学的黑天鹅（n=3），B组样品为郑州市动物园的黑天鹅（n=4），C组（n=4）和D组（n=4）样品来自迁徙至三门峡越冬的大天鹅。使用粪便DNA提取试剂盒提取粪便DNA，采用Illumina Hiseq平台进行细菌16S rRNA 基因V4—V5区域高通量测序，将下机数据经过处理和拼接后用于研究肠道菌群的差异。结果显示，A组的OTU个数显著高于其他组，OTU主成分与其他组有较大差异 ...
曹乐天 1 王璐阳 1 张艺凡 2 张凯慧 1 董睿龙 2 王悦欣 1 李丰波 2 张龙现 1
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