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基于生信数据库探究E2F3在上皮性卵巢癌中的表达及临床意义

open access: yesZhongguo shiyan zhenduanxue, 2023
目的 探讨转录因子E2F3在上皮性卵巢癌(EOC)中的表达及临床意义。方法 在癌症基因组图谱(TCGA)数据库及基因表达数据库(GEO)中分析E2F家族成员在EOC组织与正常组织中的表达差异及临床意义,同时借助生物信息数据库预测E2F3的转录调控靶点。应用RT-qPCR和Western blot检测EOC及对照组中转录因子E2F3及其靶基因的mRNA及蛋白表达水平。结果 TCGA数据信息结合GEO测序结果提示,与对照组相比在EOC中E2F1、E2F3呈现显著高表达 ...
张晶, 孔丽丽
doaj  

脂肪来源间充质干细胞调控原发免疫性血小板减少症小鼠Th细胞因子失衡

open access: yesZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2022
目的探讨脂肪来源的间充质干细胞(AMSCs)对原发免疫性血小板减少症(ITP)小鼠Th细胞因子失衡免疫调节变化及其特异性转录因子T盒子转录因子/ GATA结合蛋白3(T-bet/GATA-3)的影响,并初步探讨其相关机制。方法选取人来源健康脂肪组织,分离培养AMSCs,观察生长形态和干细胞鉴定,选取增长稳定的传代AMSCs;将30只BALB/c小鼠随机分为正常对照组(Normal组)、ITP对照组(ITP/PBS组)及ITP实验组(ITP/AMSC组)并进行相应的处理 ...
肖建红, 张阳春
doaj  

comparative analysis of Litopenaeus vannanmei by transcriptome sequencing and characterization of two immune-relevant genes [PDF]

open access: yes, 2015
南美白对虾是目前对虾养殖的主要品种,具有巨大的经济价值。然而,病害的发生严重危害其养殖业的发展,研究对虾的先天免疫反应能够给对虾养殖中病害的防治提供重要的理论基础。 转录组测序能够分析某一生理条件下细胞内所有mRNA的表达水平,本研究通过二代测序技术首次比较分析了对WSSV(whitespotsyndromevirus)抗性差异的两种南美白对虾群体的转录组,它们的基因表达水平存在明显差异,具有750个明显差异表达的基因,普通对虾及抗病对虾群体在病毒感染前后分别有479和132个差异表达基因 ...
徐景祥
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Transcriptome Sequencing Analysis of Chrysomyia Megacephala Pupae in Different Growing Periods [PDF]

open access: yes, 2021
Objective To study the growth regulation, environmental adaption and epigenetic regulation of Chrysomyia Megacephala pupae, in order to obtain the transcriptome data of Chrysomyia Megacephala in different growing periods, and lay the foundation for ...
WANG Qi-yan, ZHANG Hong-ling, REN Zheng, et al.
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Transcriptome and Proteome Analysis During Larval Settlement and Metamorphosis in Fujian Oyster(Crassostrea angulata) [PDF]

open access: yes, 2016
附着变态衔接浮游阶段与底栖阶段,是海洋无脊椎动物生活史的重要环节,附着变态过程涉及到复杂的生理过程和行为形态的改变,人们至今未能很好地阐释其中涉及到的分子机制。福建牡蛎(Crassostreaangulata)是我国南方主要的贝类养殖种之一,具有典型的附着变态过程。然而关于牡蛎附着变态过程的分子研究停留在个别基因的克隆和定量表达的研究,这并不能反映附着变态过程的多基因的调控网络。有大量的药理学研究表明肾上腺素能够诱导牡蛎幼体未经附着而直接变态,但是肾上腺素诱导的分子机制的研究至今空白。本研究采用转录组学、
肖小伙
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动脉源性栓子与心源性栓子的比较转录组学研究

open access: yesZhongguo shiyan zhenduanxue, 2022
目的 探讨动脉源性栓子与心源性栓子的转录基因差异,以期确定潜在诊断性生物标志物的种类。方法收集12例动脉源性栓子和14例心源性栓子并随机各自分成3组进行总RNA提取,采用高通量转录组学检测动脉源性栓子和心源性栓子的转录组、筛选和确定差异表达基因和转录本并进行GO和KEGG途径分析,CPAT和rMATS分别完成新转录本编码能力预测和可变剪切事件检测。结果 动脉源性栓子和心源性栓子分别鉴定出11080个和10658个基因、24759个和24166个转录本。两组栓子相比 ...
doaj  

The role and mechanism of hnRNP A2/B1 in breast cancer [PDF]

open access: yes, 2015
核不均一核糖核蛋白A2/B1(hnRNPA2/B1)是hnRNP蛋白家族成员,在肿瘤细胞增殖与凋亡过程中具有重要作用。本实验为了探究hnRNPA2/B1蛋白在乳腺癌组织中的表达及其在乳腺癌细胞中的定位。研究hnRNPA2/B1在乳腺癌细胞中所涉及的主要功能、信号通路以及可变剪接和蛋白融合过程,并探究hnRNPA2/B1对细胞增殖、凋亡、迁移等生物功能的影响。从而阐明hnRNPA2/B1在乳腺癌中的作用机制,为肿瘤的机理研究、临床诊断和治疗提供一个新靶点。本实验用免疫组化方法检测hnRNPA2 ...
韩荣
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Separation and Activity Screening of Peptides Derived from Mycale phyllophila [PDF]

open access: yes, 2015
海绵是最原始的多细胞生物,拥有许多在结构上非常多样化的生物活性物质,是最具有药物开发潜力的海洋生物资源。这些生理活性物质常具有抗肿瘤、抗病毒、抗细菌、抗真菌、杀虫、抗炎、神经抑制、神经保护、防污等作用。作为海绵活性物质中重要的组成部分,海绵活性多肽具有分子量小、结构简单、生物效应多样、免疫原性低等特点,具良好的开发潜力。叶片山海绵(Mycalephyllophila)是福建沿海资源较丰富的物种,本研究以叶片山海绵为材料,建立海绵水溶性肽类的分离纯化、活性筛选和结构测定的方法 ...
贺腾飞
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霍乱弧菌新发菌株中vipAvipBclpV对T6SS转录调控

open access: yesZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2022
目的探索霍乱弧菌新发菌株H1的六型分泌系统(T6SS)存在的转录调控机制。方法本研究以转录组测序为基础,分析H1株分别由于vipA敲除(H1ΔvipA),vipB敲除(H1ΔvipB)和clpV敲除(H1ΔclpV)时T6SS基因簇的转录水平,并对其差异基因进行了基因本体论(GO)富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集。结果发现H1ΔvipA有22个差异基因(FDR<0.01,|log2FC|≥1),其中有18个属于T6SS基因簇;并且除vipA外,其转录水平均呈上升趋势 ...
吴文轩, 郭扬, 张幸鼎, 赵文婧
doaj  

Transcriptomic study of a toxin-producing dinoflagellate Alexandrium catenella [PDF]

open access: yes, 2015
亚历山大藻(Alexandriumspp.)是一种能够产生麻痹性贝类毒素(paralyticshellfishtoxins,PSTs)的海洋甲藻,广泛分布于近海环境中。近年来由其产生的毒素导致的海洋生物死亡及人类中毒事件频发,严重威胁到近海生态系统、水产养殖业、人类健康和生命财产安全,已成为一个全球性的环境和健康问题。虽然目前在亚历山大藻毒素来源及产毒生理方面取得了较大进展,但对毒素合成机制的了解仍较少。 本论文以有毒链状亚历山大藻(Alexandriumcatenella)为研究对象 ...
张勇
core  

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