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Analysis of fatty acid synthesis pathway of Schizochytrium and Rhodomonas based on high-throughput sequencing and functional verification of malonyl-CoA:ACP transacylase [PDF]

open access: yes, 2016
裂壶藻能合成丰富的ω-3多不饱和脂肪酸,广泛应用于工业发酵生产多不饱和脂肪酸,但目前对于裂壶藻的脂肪酸合成途径等生物学问题还不明确。此外,温度对裂壶藻脂肪酸含量积累的影响尤为重要,工业上一般采用两步发酵法对裂壶藻进行发酵培养,但是两步发酵法中的降温过程会极大增加成本。因此,本研究以实验室分离得到的裂壶藻为实验材料,通过基因组测序技术系统分析裂壶藻基因组,并把脂肪酸合成关键酶-丙二酰CoA:ACP转酰基酶基因(malonyl-CoA:ACPtransacylase,MCAT)电击转入裂壶藻中 ...
李欢琴
core  

Survivin-siRNA对裸鼠视网膜母细胞瘤移植瘤的抑制研究

open access: yesZhongguo shiyan zhenduanxue, 2010
目的构建Survivin-siRNA真核重组质粒,转染裸鼠视网膜母细胞瘤玻璃体腔移植瘤中,探讨其对肿瘤组织中Survivin表达的抑制作用及诱导凋亡情况。方法构建针对Survivin mRNA特异的靶序列的Survivin-siRNA以及对照Scramble-siRNA。将Y79细胞种植至21只裸鼠玻璃体腔内,9d后随机平均分为mock对照组(注射K-PBS);Scramble对照组(注射带有非同源的Scramble-siRNA重组质粒);Survivin实验组(注射特异性Survivin ...
吴荒   +5 more
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单细胞测序在缺血再灌注领域的研究进展

open access: yesZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban
缺血再灌注损伤(IRI)往往伴有严重的临床表现,包括心肌冬眠、急性心力衰竭、脑功能障碍、肾脏功能障碍、胃肠功能障碍、肝移植排斥反应,全身炎症反应综合征、多器官功能障碍综合征等,在临床上对医生提出了重要的治疗挑战。单细胞测序技术是在单细胞水平上对基因组、转录组或表观基因组进行高通量测序,从而揭示细胞的异质性,了解细胞的发育轨迹、类型、状态和各种相互作用。自首次发现以来,单细胞测序技术已经在各个领域都得到了广泛应用,尤其是肿瘤早期诊断和个性化治疗等 ...
张洁, 杨正飞
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无蹼壁虎线粒体全基因组及系统发育分析

open access: yes野生动物学报, 2017
经PCR扩增和序列测定,获得了无蹼壁虎(Gekko swinhonis)的线粒体基因组全序列,其总长为16 818 bp,含有13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和1个控制区。各基因的位置、排列顺序及转录方向均和大部分的有鳞目物种一致。无蹼壁虎线粒体基因组的碱基组成分别为:A(31.35%)、T(26.28%)、C(27.71%)、G(14.67%)。除Ser(GCU)缺失DHU臂外,其余的21个tRNA都可以形成典型三叶草结构。13个蛋白质编码基因中 ...
秦 峰 曾德龙 高成伟 秦新民
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高原低氧环境抑制小鼠脾脏组织碳代谢的分子机制

open access: yesZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban
目的探究低氧暴露对小鼠脾脏组织碳代谢通路的调控机制。方法将C57BL/6小鼠分别在海拔400 m和4 200 m饲养,每组5只,30 d后无菌取出脾脏组织,通过转录组测序,蛋白质组学和非靶向代谢组学分析差异表达基因、差异蛋白以及差异代谢物,利用GO和KEGG富集分析,挖掘关键通路,并通过RT-qPCR和Western blot对通路中关键基因和蛋白进行验证。结果转录组测序发现,低氧暴露下有4 213个基因出现显著性差异表达,其中1 947个基因表达上调,2 266个基因表达下调 ...
陈晓晨   +5 more
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[Single-cell RNA sequencing of B cells reveals molecular typing in Sjögren syndrome]. [PDF]

open access: yesBeijing Da Xue Xue Bao Yi Xue Ban
Lin W   +6 more
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马鹿MORF4L2组织表达、基因克隆及生物信息学分析

open access: yes野生动物学报
MORF4L2是一种转录因子,通过形成NuA4组蛋白乙酰转移酶复合物来参与异染色质组装和组蛋白修饰,对细胞生长、增殖和凋亡起重要作用。为了探究马鹿(Cervus elaphus)鹿茸中MORF4L2所发挥的功能,使用qPCR技术检测鹿茸不同组织中MORF4L2基因的表达水平,采用PCR克隆马鹿MORF4L2基因的CDS序列,通过多物种比对MORF4L2基因mRNA序列进行相似性分析并构建系统进化树,利用生物信息学方法预测分析MORF4L2编码蛋白的结构与理化性质。结果显示 ...
韩青   +5 more
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[Progress of allergic rhinitis research based on transcriptome sequencing]. [PDF]

open access: yesLin Chuang Er Bi Yan Hou Tou Jing Wai Ke Za Zhi
Zhang H, Wang Y, Cheng F, An Y, Zhao C.
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PGC-1α辅助激活人PEPCK基因转录

open access: yesZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2011
【目的】构建人磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶(PEPCK)基因启动子荧光素酶报告质粒PGL3-hPCK-luc,并探讨过氧化物酶体增殖物活化受体γ辅助激活因子1α(PGC-1α)在转录因子肝细胞核因子4α(HNF4α)介导下对人PEPCK基因启动子活性的影响【方法】从人全血基因组DNA中克隆PEPCK启动子基因片段,并重组进荧光素酶报告载体PGL3-basic,将pcDNA3.1-PGC-1αpcDNA3.0-HNF4α表达质粒与PGL3-hPCK ...
doaj  

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