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Metabonomic Analysis Reveals Mechanisms for Both Renoprotection of Exendin-4 in Rats with Diabetic Kidney Disease and Adaptation of Microbacterium YLB-01 to High Pressure and Low Temperature [PDF]
基于核磁共振(NMR)的代谢组学是一门新兴的“组学”学科,它将1H-NMR波谱检测技术和模式识别分析技术相结合,被广泛应用于疾病的早期诊断、病理机制、药物的药效评估、微生物环境胁迫适应性等研究。本论文应用基于NMR技术的代谢组学方法,研究艾塞那肽Exendin-4(胰高血糖素样肽-1(GPL-1)类药物)对糖尿病肾病(DKD)大鼠的肾功能保护机制以及深海沉积微杆菌YLB-01耐受高压低温的分子机制。 糖尿病肾病(DKD)发病机制尚不完全明确。最近的研究表明GLP-1类药物(如Exendin-4 ...
胡晓敏
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New methods of NMR-based metabonomics data processing and its application [PDF]
代谢组学是关于定量描述生物内源性代谢物质的整体及其对内因和外因变化应答规律的科学,是系统生物学的有机组成部分。以核磁共振(NuclearMagneticResonance,NMR)为主要分析手段的代谢组学通常称为NMR代谢组学,已经广泛地应用到了包括药物研发,分子生理学,分子病理学,基因功能组学,营养学,环境科学等重要领域。NMR代谢组学的数据具有非线性、高维性、小样本性等特点,开发符合这些特性、且具有一定普适性的数据分析方法是代谢组学发展的关键。本文从数据预处理和数据分析两个方面入手 ...
徐乐
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圈养动物尿液中含有丰富的代谢产物,是代谢组学分析中用以判定动物发情、妊娠、健康状态、应激水平及动物福利的重要生物检材。因采样困难及安全考虑,目前多选择动物离开或转移后采集遗留在圈舍地面的尿液样本,这种样本容易被污染而影响检测结果,因此探索一种低污染、方便且快捷的尿液采集和预处理方法非常必要。针对8只(3♀,5)圈养大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)的27份尿液样品,分别采用不做处理(对照组)、0.22 μm滤膜过滤和添加叠氮钠3种预处理方法,然后通过微生物培养 ...
闫拯 +12 more
doaj
Study on Peak Alignment and Data Normalization for NMR-based Metabonomics [PDF]
代谢组学(metabonomics)是研究生物体受病理/生理刺激或基因改变后,定量分析内源性代谢产物的整体组成及其变化规律的科学。经过十几年的快速发展,代谢组学已成功地应用到病理学、毒理学、药理学、疾病诊断等诸多领域。核磁共振(NMR)由于其独特的优势,已成为代谢组学数据获取的重要手段之一。但由于生物系统及外部环境的复杂性,样本制备及实验操作的差异性,以及数据的高维度,代谢组学的数据分析常常面临巨大挑战。数据预处理可很大程度上抑制干扰,规范数据,有利于模式识别准确性的提高和生物标志物的发现 ...
黄赫
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Plant phenomics is under rapid development in recent years, a research field that is progressing towards integration, scalability, multi-perceptivity and high-throughput analysis.
Guohui, Ding +6 more
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NMR-based metabolomic analysis for mechanisms of both protections of HDL and apoA-I mimetic peptide D-4F, and injury of contrast media on endothelial cells [PDF]
细胞代谢组学将高通量检测技术与多种数据分析方法结合,用于揭示细胞内整体、动态的代谢变化,在药物研究中发挥着重要的作用。本论文采用基于1H核磁共振(NMR)的细胞代谢组学方法,探讨与内皮细胞代谢相关的药物作用机制。 研究表明,载脂蛋白A-I(apoA-I)模拟肽D-4F展现出许多与高密度脂蛋白(HDL)相似的内皮保护功能。但是,目前并不清楚D-4F的内皮保护机制是否与HDL完全一样。因此,我们运用基于1HNMR的代谢组学方法,比较HDL和D-4F拮抗氧化型低密度脂蛋白(ox-LDL ...
徐文琦
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目的研究脂代谢相关指标与血清β2-微球蛋白增高是否具有相关性。方法将3721例临床标本数据按照血清β2-微球蛋白差异分为正常β2-微球蛋白组和高β2-微球蛋白组,然后按性别分为男性正常组、男性高β2-微球蛋白组、女性正常组、女性高β2-微球蛋白组,分别对其进行脂代谢生化指标统计分析。结果高β2-微球蛋白组与正常组脂代谢相关指标比较,高β2-微球蛋白组的载脂蛋白A1、高密度脂蛋白胆固醇低于正常组,具有统计学意义 ...
陈玲, 刘永胜, 甘露
doaj
目的探讨糖代谢异常的Ⅰ期子宫内膜样腺癌(EA)患者预后差异及其影响因素。方法选取2015年1月至2019年12月期间在中山大学孙逸仙纪念医院妇科肿瘤专科行手术治疗的Ⅰ期EA患者共387例,根据糖代谢是否正常分为糖代谢异常(IGM)组和糖耐量正常(NGT)组。其中IGM组分三个亚组,即糖尿病(DM)组、糖耐量异常(IGT)组、空腹血糖受损(IFG)组。回顾性分析各组临床病理指标及预后,探讨糖代谢异常对Ⅰ期子宫内膜样腺癌患者预后的影响及影响预后的相关因素 ...
刘畅浩 +4 more
doaj
New Variable Scaling Method for Metabolomic Data Analysis and its Application [PDF]
代谢组学,即利用高通量、高灵敏度与高精确度的现代分析技术,结合模式识别方法研究生物体系在受到外界刺激或干扰因素后,其内源性小分子代谢产物的动态变化,探究代谢模式变化与生命现象之间的关系,已成为当今系统生物学的一个研究热点领域。随着研究的深入,数据分析的问题越来越突出,并已成为代谢组学研究的关键技术和瓶颈之一。本文以代谢组学数据尺度缩放为主要研究内容,发展新的代谢组学数据分析方法,并将其应用于鱼类营养代谢组学研究中。主要的研究内容包括: 一、提出了模型自适应尺度缩放方法。该方法根据后续的多元统计模型 ...
刘新卓
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目的对总胆红素与代谢综合征及其组分之间的关系进行研究,同时明确代谢综合征的发病风险。方法以我院体检中心健康人群2131人为对象,根据总胆红素水平分为T1组、T2组、T3组、T4组,对其各项体检数据以及生化指标检测结果进行收集整理,分析各组各项指标结果、患病风险以及行ROC曲线评价。结果 T1、T2、T3、T4组DBP、HDL-C水平比较,有显著差异(P0.05);T1组与中心性肥胖、高血糖、高甘油三酯血症、低(HDL-C)差异有统计学意义 ...
周健
doaj

